文档介绍：!""# $%%&’(&)( 细胞与分子免疫学杂志* + ,-.. /0. !%%$6 $& *5 4 $5)
· 研究原著· 文章编号:$%%&’(&)(*5%%$4%5’$5)’%)
通过序列分析筛选单纯疱疹病毒 I 型蛋白组中的 PACS-1 结合蛋白
刘军,李英辉,薛采芳,甄荣芬,李旬,王宪锋,刘忠湘,万磊
*第四军医大学病原生物学教研室,陕西西安&$%%)5 4
关键词:单纯疱疹病毒! 型;=>,"’$;蛋白组;序列分氨酸或谷氨酸的区域,可将这些蛋白质与细胞经
析;生物信息学
典转运系统中的>=’$ 连接,从而使这些蛋白质定
中图分类号:?)&)8 $ @ $ 文献标识码:>
位于细胞的高尔基体外侧网络* FCB3D’ 3-F’
〔〕
, 中$ 。已经实验证实,可与结
摘要:目的筛选单纯疱疹病毒! 型蛋白组中的=>,"’$ 结‘0Ca :T#4 =>,"’$
合蛋白。方法根据筛选标准,利用"AB3=C0DEF- 和="G?: 合的蛋白质,包括:弗林蛋白酶* P2CE34 、不依赖阳
软件对蛋白质进行分析,并结合相关文献中的实验数据对
离子的<’磷酸甘露糖受体、水痘’带状疱疹病毒
分析结果进行校正。结果该方法可有效地筛选出
〔〕
=>,"’$ 的糖蛋白和人免疫缺陷病毒的蛋白$J 5 。因
结合蛋白。利用该方法,在单纯疱疹病毒型蛋白组中, O #-P
! 此, 在细胞内蛋白质的转运、定位及某些
共筛选出可能与=>,"’$ 结合的蛋白质)) 种。结论建立=>,"’$
病毒的发生与免疫逃避中发挥重要的作用。
了一种有效的筛选=>,"’$ 结合蛋白的方法。筛选出的单纯
疱疹病毒型的结合蛋白,将为研究在疱
! =>,"’$ =>,"’$ 在研究=>,"’$ 在单纯疱疹病毒! 型发生及其
疹病毒发生及潜伏性感染中的作用提供指导。潜伏性感染中的作用过程中,我们首先利用生物
信息学的手段,通过序列分析的方法,对单纯疱
Screening for PACS-1 binding protein in herpes 疹病毒型蛋白组中的所有蛋白质进行筛选,得到
simplex virus-1 proteome by sequence analysis !
了一些可能与=>,"’$ 结合的蛋白,为我们的实验
H!I +23J H! KE3L’M2EJ NIO ,BE’PB3LJ QRO# ?03L’研究提供了指导。
P-3J H! N23J S>#T NEB3’P-3LJ H!I QM03L’UEB3LJ
材料和方法
S># H-E $
V-WBCF1-3F 0P Y02CFM / /-ZEAB. I3E[-CDEFXJ NE\ $8 $ 材料单纯疱疹病毒! 型所有蛋白质的氨基酸
B3 &$%%)5J "MBB3UE =C0[E3A-J ,ME3B 序列及对其进行分析的软件,均来自瑞士生物信
息学研究所的分子生物学服务器*
Keywords: M-CW-D DE1W.-U [EC2D’$6 =>,"’$6 WC0F-01-6 OU=>"X ‘‘‘8
〔〕
) 。其中,蛋白质的氨基酸序列来自