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当发展到喜马拉雅运动后期时，不行阻挡的震撼，又使峨眉山出现了常见的新构造。其挤压应力以西北——东南方向的分压应力为主，不仅使峨眉山断层规模增大，而且切割到基地的花岗岩体，使峨眉山主体沿断层剧烈抬升，最终形成今日之雄姿。
峨眉山的地质演化史，概括起来，就是“八亿年的孕育，七千万年的成长，
二百万年的春风时雨和潜移默化”。在数千万年的演化过程中，经验多数次剧烈的地壳运动，形成对种类型的地质构造，在国际上划分的13个地质带中，除缺失中、晚奥陶纪、志留纪、泥盆纪和石炭纪外，其余各时代地层均有沉积，因此被誉为“地质博物馆”
（二）、今朝之峨眉构造
峨眉山地跨上扬子台褶皱带的峨眉山断拱和川西台陷，是一座断块山其构造较困难。其主要构造为：
1、褶皱
1）、峨眉山背斜：它位于张沟——洪椿坪一带，轴向近南北，长约七公里。由于南北两端分别为峨眉山大断层和观心坡断层所斩断，故目前所见只是其一段残体。其核部宽缓，出露最老岩层为峨眉山花岗岩。两翼不对称，西翼展布约十八公里。出露地层为震旦系-下三叠系统嘉陵江组，倾角10—12度。东翼展布约五公里，出露地层为震旦系-下第三系，倾角16—50度，倾角陡立，在凉风峡——鞠家峡一带为变为倒转层序。故属不对称倒转背斜。
2)、万年寺向斜（又名桂花场向斜）：位于纯阳殿——桂花场一带。轴向北西约50度，长约30公里，整体向北西倾伏呈箕状。被响水洞断层、灰厂沟断层错为两段；南东段由纯阳殿至桂花场，核部狭窄。北西段由红岩脚至黄湾，核部宽缓。两翼倾角6—45度。向斜快速撒开，渐渐过渡为单斜。
3）、挖断山背斜（又称牛背山背斜）位于龙门洞雷岩一带，为本区次一级褶皱构造轴向北西约45度长约十二公里。核部最老地层为下二叠统（P1）翼部为上二叠统(P2)和三叠系地层。西南翼岩层产状正常，倾角中等。北段黑水岗至雷岩，两翼较对称，倾角15—50度；中段和南段，受牛背山断层的影响，两翼不对称。东北翼近核部地层产状正常。但远离核部发生倒转。另外，背斜枢纽均发生倾没，故属小型短轴倒转背斜构造。保存完整，轴部尚有挖断山断层穿过。
2、断层：本区断层属压性逆断层。主要有以下几个断层：
1)、峨眉山大断层：是本区最大的一个断层构造，它对本区构造单元的划分及地貌特征都起着限制作用。分布与峨眉山东南侧，在本区域范围内，由西南杨村铺旁边，北东经张山，至峨眉山市中区。区内长约40多公里，走向北东，
倾向北西断面波状。倾角50—70度。北西盘逆冲于南东盘之上。北西盘往往发育拖拽褶皱和派生断层，东南盘地层局部倒转，并伴生一系列小褶皱和小断层。该断层最大断距部位在其核部，断距达3500余米，即北西盘峨眉山花岗岩逆冲于南东盘中三叠统雷口坡组之上。而北东段，也就是位于峨眉断陷盆地北西边缘，大部分被第四系掩盖，呈断续出露。
2) 观心坡断层：规模较峨眉山断层小，东起纯阳殿一带，向西经观心坡至脚盆坝，全长18公里主断层线露头略呈舒缓的反“S”状，东西两端走向近东西。中段北