文档介绍：关于微生物分类
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1、生物界的分类
地球上的物种估计大约有150万，其中微生物超过10万种，而且其数目还在不断增加。
在生物进化历史过程中演化形成生物种类和种群的多样性。
生物分类就是通过研究生12获得某aa的缺陷型， k12的亚种。
型(form): 常指亚种以下的细分。当同种或同亚种内不同菌株之间的性状差异不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。 例如：按抗原特征的差异分为不同的血清型；
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学名—是微生物的科学名称，它是按照有关微生物分类国际委员会拟定的法则命名的。学名由拉丁词、或拉丁化的外来词组成。学名的命名有双名法和三名法两种。
①双名法：
学名=属名+种名+（首次定名人）+现定名人+定名年份
属名：拉丁文的名词或用作名词的形容词，单数，首字母大写，表示微生物的主要特征，由微生物构造，形状或由科学家命名。
种名：拉丁文形容词，字首小写，为微生物次要特征， 如微生物色素、形状、来源或科学家姓名等。
4、微生物的命名
必要，用斜体表示
可省略，用正体字
微生物的名字有俗名和学名两种。如： 红色面包霉———粗糙脉孢霉
绿脓杆菌———铜绿假单胞菌
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例：大肠埃希氏杆菌
Escherichia coli （Migula）Castellani et Chalmers 1919
金黄色葡萄球菌
Staphylococcus aureus Rosenbach 1884
◆当泛指某一属微生物，而不特指该属中某一种（或未定种名）时，.（分别代表species 缩写的单数和复数形式）
例如：Saccharomyces sp.
表示酵母菌属中的一个种。
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◆菌株名称——在种名后面自行加上数字、地名或符号等，如： Bacillus subtilis AS=Academia Sinica
Bacillus subtilis BF7658 BF=北纺
Clostridium acetobutylicum ATCC824 ***丁醇梭菌
ATCC＝American Type Culture Collection美国模式菌种保藏中心
◆当文章中前面已出现过某学名时，后面的可将其属名缩写成1~3个字母。
如：Escherichia coli 可缩写成
Staphylococcus aureus可缩写成 S. aureus
②三名法：用于对亚种的命名，这时在属和种名后加写一个subsp.，然后再附上亚种名称（斜排体）。 如：
Bacillus thuringiensis subsp. galleria
苏云金芽孢杆菌腊螟亚种
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形态结构、生理生化、少量的化石资料、行为****性，等等
表型特征：
5、 进化指征的选择:
b）形态特征在不同类群中进化速度差异很大，仅根据形态推断进化关系往往不准确；
缺点：
a）由于微生物可利用的形态特征少，很难把所有生物放在同一水平上进行比较；
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蛋白质、RNA和DNA序列进化变化的显著特点是进化速率相对恒定，也就是说，分子序列进化的改变量(氨基酸或核苷酸替换数或替换百分率)与分子进化的时间成正比。
生物大分子作为进化标尺依据
a）在两群生物中，如果同一种分子的序列差异很大时，
------------进化距离远，进化过程中很早就分支了。
b）如果两群生物同一来源的大分子的序列基本相同，
------------处在同一进化水平上。
大量的资料表明：功能重要的大分子、或者大分子中功能重要
的区域，比功能不重要的分子或分子区域进化变化速度低。
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RNA作为进化的指征
16S rRNA被普遍公认为是一把好的谱系分析的“分子尺”：
1）rRNA具有重要且恒定的生理功能；
2）在16SrRNA分子中，既含有高度保守的序列区域，又有中度保守和高度变化的序列区域，因而它适用于进化距离不同的各类生物亲缘关系的研究；
3）16SrRNA分子量大小适中，便于序列分析；
4）rRNA在细胞中含量大(约占细胞中RNA的90%)，也易于提取；
5）16S