文档介绍：分子生物学基因组与比较基因组学
第一页，讲稿共三十八页哦
1. 基因组的概念
一种生物或一种遗传系统的所有基因
（遗传物质）的组合
染色体组（chromosome set）
基因组（genome）
第二页，讲稿共三十八功能基因组学（functional genomics）
（3）进化基因组学（evolutionary genomics）
基因组学的三个“时代”
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3. 基因组学
（1）结构基因组学（structural genomics）
基因组结构（genome structure）
种类、结构特点、种属特异性
定位基因（gene mapping）
遗传图谱（genetic map）与物理图谱（physical map）
测定基因组全序列（whole-genome sequencing）
结构基因组学研究的主要目标
人类基因组计划（the Human Genome Project）之前，只测定过
一些病毒（X174、、T4等）的基因组全序列
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Phage X174: 5375 nt
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基因组全序列的测定
 1995  嗜血流感菌（Haemophilus influenzae） 1,830 kb
枝原体 Mycoplasma genitalium 580,070 bp，预计有500个基因
1996  古细菌 Methanococcus jannaschii 1,660 kb
酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） 12,068 kb，近6,000个潜在
的蛋白质编码基因，近150个rRNA基因，近300个tRNA基因，还有几十个
核小分子RNA（snRNA）基因和一大批核仁小分子RNA （snoRNA）基因
1997  大肠杆菌（Escherichia coli） 4,639 kb
（目前已测定几十种微生物的全序列）
多细胞生物
1998 秀丽隐杆线虫（Caenorhabditis elegans） 97,000 kb
2000 黑腹果蝇（Drosophila melanogaster） 180,000 kb
2000 拟南芥（Arabidopsis thaliana） 120,000 kb
2000（6月） 人类（Homo sapiens） 3,120,000 kb
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人类基因组计划
(*)
意义 ( p369)
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遗传图
(1) 又称为连锁图, 基因(或DNA标志)在染色体上的相对位置(遗传距离).
(2)基因的重组频率与两个位点的距离成正相关 ,---不重组,重组率为0.
(3)有专门的计算公式,对复杂重组计算可能不准确.
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(4) 遗传标记
形态学标记
蛋白标记
生物化学标记
DNA标记
第一代 RFLP (限制性片段长度多态性)
第二代短串联重复序列（short tandom repeat,
STR, 重复次数多态性,小卫星DNA, 微卫星DNA)
第三代SNP (单核苷酸多态性)
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物理图
以已知DNA序列片段(序列标签位点, STS)为路标, 以碱基对(bp)为基本测量单位的基因组图.
STS只是基因组中单拷贝的短DNA序列.
建立物理图,需要得到5套该基因组的DN***段.(建立相互重叠的相连DN***段群)
比较准确
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序列图
序列图是指整个人类基因组的核苷酸序列图，也是最详尽的物理图。
代表性人类个体
24条染色体, 约30亿对核苷酸
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转录图
在整个人类基因组中，只有1%～5%的DNA序