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玉米的那些事，三天三夜都讲不完
--我们坐在高高的玉米堆旁边，听它的故事
玉米（Zeamays），禾本科（Gramineae）玉蜀黍属（Zea），是一年生雌雄同株异花授粉植物，现在广泛种植的品种大多为杂交种，其中以“瑞德黄马牙”（通过比较基因组学揭示了B73和Mo17基因组间的CNV、PAV等，⑹。玉米W22和Ki11基因组与B73基因组差异巨大⑸。因此，利用B73参考基因组研究其他品种的玉米具有一定的局限性。
近日，Naturegenetics同期发表玉米Mo17和W22参考基因组。中国农业大学赖锦盛研究组利用PacBio和BioNano技术组装了玉米Mo17基因组，大小约2,183Mb，注释了38,620个蛋白质编码基因，与B73基因组比较，发现超过25Mb的区域存在PAV大的结构变异，超过10%的区域是相互非同源的，超过20%的基因具有突变或大的结构变异
[7]
唐纳德丹福斯植物科学中心的研究人员利用lllumina和10Xgenomics组装了玉米W22参考基因组，大小约2,134Mb，与B73基因组相比，转座子组成、拷贝数变异、单核苷多态性等多种尺度上存在显著的结构异质性［8］。
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ExtensiveintraspecificgeneorderandgenestructuralvariationsbetweenMo17andothermaizegenomesARTICLESOPEN
ThemaizeW22genomeprovidesafoundationforfunctionalgenomicsandtransposonbiology图6玉米Mo17和W22基因组发表
玉米在驯化和改良过程中产生了遗传瓶颈效应，再加上不同品种间广泛的杂交，使得不同玉米品种间具有显著的遗传变异。某些品种的基因组信息并不能代表所有玉米的遗传变异，因此，对于广泛种植的玉米品种进行基因组测序，有助于玉米的育种工作及功能基因组学研究，如玉米PH207参考基因组的公布加速了该品种的遗传育种工作［9］。
玉米从驯化至今，植株形态和适应性发生了巨大的变化，颖壳、产量、抗性等相关基因受到了强烈的选择。大刍草的籽粒外层有颖壳保护不易被动物消化掉，而玉米种子无颖壳包被易被动物消化，颖壳性状的有无是大刍草向现代玉米驯化的第一步。美国明尼苏达大学的Doebley研究团队首次将控制颖壳性状的基因定位于玉米4号染色体的短臂，并确定该性状是由单基因控制（候选基因tgal）［10］。后来，该团队又精细定位了tgal基因，并确认该基因是含有SBP结构域的转录因子［11］。最后，该团队进一步证实了单氨基酸替换是tgal基因控制颖壳性状的遗传基础［12］b9-1A20
-S-COO-1,
wjst*
图7玉米颖壳相关基因tga1的定位
除此之外，产量和抗性性状也尤为重要。籽粒（粒数、粒长、粒重等）是影响玉米产量的重要因素之一，华中农业大学张祖新团队揭示了KRN4通过调控UB3基因的表达控制玉米每穗籽粒数目［13］，严建兵课题组研究了影响玉米籽粒大小和重量的ZmINCWI基