1 / 43
文档名称:

生物信息学课件.ppt

格式:ppt   大小:1,050KB   页数:43页
下载后只包含 1 个 PPT 格式的文档,没有任何的图纸或源代码,查看文件列表

如果您已付费下载过本站文档,您可以点这里二次下载

分享

预览

生物信息学课件.ppt

上传人:放射辐射 2022/4/10 文件大小:1.03 MB

下载得到文件列表

生物信息学课件.ppt

文档介绍

文档介绍:生物信息学课件
计算机学、计算机网络
医学
生物学、
分子生物学
生物信息学
数学、 统计学
生物信息学和其它学科的关系
生物信息学是一门边缘学科,它位于生物、医学、计算机、数学等多个领域的交叉点究局部性质
分子动力学模拟
研究蛋白质的构象及动力学,是计算机模拟实验的基础
遗传学运算规则
Optimisers / Evolvers
DNA computing
Evolutionary Computation (Metaphors from DNA to Selection)
生物信息学的研究方法和技术
“Half day on the Web,saves you half month in the lab”
专家系统
将有关专家的知识和经验以一定的知识表示形式(如产生式规则、语义网络等)存放在计算中以智能的方式帮助提供参考性决策。如用于基因识别
Internet技术
交流:通过Internet网交流生物分子数据
查阅:从Internet网上查生物分子数据,如原始的序列、结构数据,加工处理的数据
服务:将所要处理的数据直接送到相应的网络服务器上,服务器接受你的处理请求,并将处理结果返回给你
生物信息学的研究方法和技术
国外一直非常重视生物信息学的发展,各种专业研究机构和公司如雨后春笋般涌现出来,生物科技公司和制药工业内部的生物信息学部门的数量也与日俱增
1979年,美国洛斯阿拉莫斯国家实验室建立起GenBank数据库;
1982年,欧洲分子生物学实验室提供核酸序列数据库EMBL的服务;
1984年,日本着手建立国家级的核酸序列数据库DDBJ并于1987年开始提供服务
四、常用的分子生物学软件和数据库(p210)
国内对生物信息学领域也越来越重视
1997年3月,北京大学于成立了生物信息学中心;
2000年3月,中科院上海生命科学研究院成立
其他,北京大学的罗静初和顾孝诚教授在生物信息学网站建设方面、中科院生物物理所的陈润生研究员在EST序列拼接方面以及在基因组演化方面、天津大学的张春霆院士在DNA序列的几何学分析方面等等……
软件和数据库
基因图谱数据库
核酸序列数据库
蛋白质序列数据库
大分子结构数据库等
国际著名的生物信息中心
NCBI National Center for Biotechnology Information (US) 
EBI European Bioinformatics Institute (EU)
HGMP Human Genome Mapping Project Resource Centre (UK )
ExPASy Expert of Protein Analysis System (Switzerland )
CMBI Centre of Molecular and Biomolecule (The Netherlands)
ANGIS National Genome Information Service (Australia) 
NIG National Institute of Genetics (Japan)
BIC National Bioinformatics Centre (Singapore)
1. 数据库
国内部分生物信息学和生物医学信息服务器
北京大学生物信息中心
中国生物信息/
北京大学物理化学研究所
北京医科大学生物医学信息
中国科学院微生物研究所
天津大学生物信息中心
中科院计算所智能信息处理重点实验室生物信息学研究组 /
中国科学院基因组信息学中心 /
DNA数据库
Genbank
包含所有已知的核酸序列和蛋白质序列,以及相关的文献著作和生物学注释。
美国国立生物技术信息中心(NCBI)建立和维护
EMBL核酸序列数据库
由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护
通过因特网上的序列提取系统(SRS)服务完成查询检索。
DDBJ数据库
日本国立遗传学研究所维护
与Genbank和EMBL核酸库合作交换数据。使用主页上SRS工具进行数据检索和序列分析
全球数据已实现同步化
Global data synchronization
软件和数据库
GenBank的