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几种PCR扩增的比较.docx

上传人:wenjiaosuoa 2022/4/13 文件大小:30 KB

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文档介绍

文档介绍:普通PCR原位PCR反向PCF^反转录PCR勺基本原理和操作步骤普通PCR
1概述聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction),简称PCR是一种分子生物学技术,用丁放大特定的DN"段。可看作生物体外的特殊DNAfi制。应,一般在2〜4小时完成扩增反应。扩增产物一般用电泳分析,不一定要用同位素,无放射性污染、易推广。
,DNA粗制品及RNA匀可作为扩增模板。可直接用临床标本如血液、体腔液、洗嗽液、毛发、细胞、活组织等DNAT增检测。
,不出现扩增条带PC版应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量,④PCR®环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。
模板:①模板中含有杂蛋白质,②模板中含有Taq酶抑制剂,③模板中蛋白质没有消化除净,特别是染色体中的组蛋白,④在提取制备模板时丢失过多,或吸入酚。⑤模板核酸变性不彻底。在酶和引物质量好时,不出现扩增带,极有可能是标本的消化处理,模板核酸提取过程出了毛病,因而要配制有效而稳定的消化处理液,其程序亦应固定不宜随意更改。
酶失活:需更换新酶,或新旧两种酶同时使用,以分析是否因酶的活性丧失或不够而导致假阴性。需注意的是有时忘加Taq酶或漠乙锭。
引物:引物质量、引物的浓度、两条引物的浓度是否对称,是PCRfe败或扩增条带不理想、容易弥散的常见原因。有些批号的引物合成质量有问题,两条引物一条浓度高,一条浓度低,造成低效率的不对称扩增,对策为:①选定一个好的引物合成单位。②引物的浓度不仅要看。则,更要注重引物原液做琼脂糖凝胶电泳,一定要有引物条带出现,而且两引物带的亮度应大体一致,如一条引物有条带,一条引物无条带,此时做PCR有可能失败,应和引物合成单位协商解决。如一条引物亮度高,一条亮度低,在稀释引物时要平■衡其浓度。③引物应高浓度小量分装保存,防止多次冻融或长期放冰箱冷藏部分,导致引物变质降解失效。④引物设计不合理,如引物长度不够,引物之间形成二聚体等。
Mg2袜度:M2+>度对PCRT增效率影响很大,浓度过高可降低PC"增的特异性,浓度过低则影响
PCFT增产量甚至使PCFT增失败而不出扩增条带。反应体积的改变:通常进行PCRT增采用的体积为20ul、30ul、50ul或100ul,应用多大体积进行PCFT增,是根据科研和临床检测不同目的而设定,在做小体积如20ul后,再做大体积时,一定要模索条件,否则容易失败。
物理原因:变性对PCFT增来说相当重要,如变性温度低,变性时间短,极有可能出现假阴性;退火温度过低,可致非特异性扩增而降低特异性扩增效率,退火温度过高影响引物与模板的结合而降低PCFT增效率。有时还有必要用标准的温度计,检测一下扩增仪或水溶锅内的变性、退火和延伸温度。
靶序列变异:如靶序列发生突变或缺失,影响引物与模板特异性结合,或因靶序列某段缺失使引物与模板失去互补序列,其PCFT增是不会成功的。
,有时其条带更整齐,亮度更高。
引物设计不合适:选择的扩增序列与非目的扩增序列有同源性,因而在进行PCF扩增时,扩增出的PCFT物为非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出现假阳性。需重新设计引物。