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蔷薇盘二孢全基因组测序及比较基因组分析 陈俊祥.pdf

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上传人:学习好资料 2022/4/25 文件大小:586 KB

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文档介绍

文档介绍:分子植物育种
Molecular Plant Breeding
ISSN 1672-416X,CN 46-1068/S

具有保守性,其核心基因占基因家族总数目的 98%,同时,预测共得到 44 个物种特异性碳水化
合物水解酶基因和 145 个物种特异性小分泌蛋白基因。此外,通过基因组注释和长距离 PCR,我们鉴定
了 交配型位点,并发现单个菌株仅包含一种交配类型,证实 具有异宗配合的交配系统,
提示不同菌株之间可通过异交进行遗传物质的重组。本研究显示 M. rosae NL1 和 M. rosae DortE4 两个菌
株具有较高的遗传多样性,提示 种内的不同菌株在致病性、适应性上可能存在差异。
关键词 蔷薇盘二孢; 全基因组测序; 比较基因组; 交配型位点
Whole Genome Sequencing and Comparative Genomics Analysis of
Marssonina rosae
Chen Junxiang Cheng Qiang *
College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing, 210037
* Corresponding author, ******@
Abstract Rose black spot caused by Marssonina rosae is an important disease in the world . The study of
genetic variation of genome can provide some reference for the establishment of effective biological
control of rose black spot. In this study, the whole genome of NL1 was sequenced and assembled by
Illumina HiSeq sequencing platform, and compared with strain DortE4. The results showed that the
NL1 genome s