文档介绍:ICS 65. 020. 01816
DB36
江 西 省 地 方 标 准
DB 36/ XXXXX—XXXX
柑橘裂皮病和柑橘碎叶病的RT-PCR检测方
法
Detection of Citrus exocortis viru理或购买无DNA/RNA酶的实验器具。
——PCR扩增仪。
高速台式离心机。
——生物安全柜或超净工作台。
——冰箱(冷藏室4°C和冷冻室-20°C) o
涡旋混匀仪。
制冰机。
——微量可调移液器。
——核酸电泳仪(配电泳槽)。
凝胶成像系统
超纯水仪。
高压灭菌锅。
——手持式植物组织研磨器。
微量核酸测定仪。
离心管(0. 5mL, 1. 5mL, 2. OmL)
——PCR反应管。
——枪头(lOOO^L, 200(iL, 10(iL)
除非另有说明,本标准所用试剂均为生物试剂(BR)。
——焦碳酸二乙酯(DEPC) o
——RNA抽提试剂(TriZol)。
氯仿-异戊醇(24: 1) o
——异丙醇,分析纯试剂。
——无水乙醇,分析纯试剂。
——四甲基乙二胺二钠盐(EDTA-Na2),分析纯试剂。
——三羟甲基氨基甲烷(Tris) , (GR) o
——浓盐酸(HC1),分析纯试剂。
——冰醋酸,分析纯试剂。
——蔗糖,分析纯试剂。
——漠酚蓝,分析纯试剂。
——氢氧化钠,分析纯试剂。
二甲苯青FFo
——随机引物6N。
——RT 缓冲液[5xPCR buffer] 0
——dNTP [2. 5mM]:脱氧核糖三磷酸腺昔混合物。
——逆转录酶(M-MLV) [200U/nL]。
——酶抑制剂(RRI) [40U/gL] o
DNA 聚合酶混合物(Premix Taq) [DNA Polymerase、Buffer、dNTP Mixture 的 2 倍浓度的混 合物,500gL] „
lOObp 梯度 DNA 标准分子量(Marker) : lOObp DNA ladder0
——电泳缓冲液(50xTAE) o
琼脂糖。
——漠化乙锭(EB)。
样品缓冲液:6xLoading Buffer0
——PCR 缓冲液[lOxPCR buffer] 0
——Taq 酶[5 U/(jL] 0
8样品采集
1取(制)样物品
枝剪、剪刀、打孔器等工具类,使用前后应121±2°C高压灭菌20min;样品袋、刀片、手套等耗材
类应一次性使用,避免样品间相互污染。
显症或疑似症状(参见附录A)的植株:
种苗采集苗木中部枝条1支,每支枝条至少带3片叶片。
成年树采集树干中部枝条1支,每支枝条至少带3片叶片。
种苗每3个枝条为1个样品;成年树每5个枝条为1个样品。新鲜样品装入可密封塑料袋中,编号 并密封保存,及时寄送实验室检验。
8. 3样品的保存
采集的样品在2°C~8°C条件下保存应不超过1周,若需长期保存,应置于-70°C以下。检测后剩余 的样品4©条件下保存7天。
9样品RNA制备
实验室样品应充分均一再制备为测试样品。
根据样品材料的特性选择合适的RAN提取纯化方法,样品RNA制备过程在实验室样品制备区进 行,避免交叉污染。所制备的RNA样本在4 °C条件下保存应不超过7天,在-2(TC冻存不超过30天, 避免反复冻融。
1采用TriZol法制备样品RNA,参考操作步骤:
1) 工作台和操作者双手应消毒灭菌。戴手套,用刀片在纸上切取样品较嫩的组织,取其中约 lOOmg组织碎屑作为测试样品,装入1. 5mL离心管,迅速转移到液氮中。
2) 将装有测试样品的离心管置于液氮中,用植物组织研磨器将样品制成粉末状,盖好离心管 盖置于冰上。根据测试样品量加入400皿~1000叫的TriZol试剂,振荡器上剧烈震荡15s, 室温下静置lOmino
3) 将上述样品4°C下12900rpm离心5min后放置于冰上。吸取上清液,转移到新的1. 5mL离 心管内。加入所用TriZol试剂1/5体积氯仿-异戊醇溶液,振荡器上剧烈震荡10s后放置 于冰上10mino
4) 将上述样品4°CT 12900rpm离心lOmin后放置于冰上。吸取上清液,约为所用TriZol试 剂1/2体积,转移到新的1. 5mL离心管内。加入4°C预冷的异丙醇溶液,约为所用TriZol 试剂1/2体积,上下轻柔颠倒离心管,-20°CT静置2小时。
5) 将上述样品4°C下12900rpm离心lOmin后,弃除上清液,冰上加入4°C预冷的75%乙醇溶 液ImL,上下颠倒离心管洗涤沉淀,4°C下7000rpm离心Imin收集半透