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《质粒提取方法》.ppt

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文档介绍

文档介绍:质粒三种提取方法的比较
基因工程原理与技术实验部分:
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质粒(Plasmid)是一种染色体外的稳定遗传因子,大小从1-200kb不等,为双链、闭环的DNA分子,并以超螺旋状态存在于宿主细胞中。质粒主要发现于细菌、放线,高压灭菌15分钟,储存于4℃冰箱。
7、溶液Ⅱ: mol/L NaOH (临用前用5-10mol/L NaOH母液稀释),1% SDS。   8、溶液Ⅲ:5 mol/L KAc 60ml,冰醋酸 , H2O ,定容至100ml, 并高压灭菌。溶液终浓度为: K+ 3mol/L, Acˉ 5mol/L。
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9、RNA酶A母液:将RNA酶A溶于10mmol/L Tris·Cl(), 15mmol/L NaCl中,配成10mg/ml的溶液,于100℃加热15分钟,使混有的DNA酶失活。 eppendorf管分装成小份保存于-20℃。   10、饱和酚:市售酚中含有醌等氧化物,这些产物可引起磷酸二酯键的断裂及导致RNA和DNA的交联,应在160℃用冷凝管进行重蒸。%的8-羟基喹啉(作为抗氧化剂), Tris·Cl () Tris·Cl(),因为酸性条件下DNA会分配于有机相。   11、 ***仿:按***仿:异戊醇=24:1体积比加入异戊醇。***仿可使蛋白变性并有助于液相与有机相的分开,异戊醇则可起消除抽提过程中出现的泡沫。   按体积/体积=1:1混合上述饱和酚与***仿即得酚/***仿(1:1)。酚和***仿均有很强的腐蚀性,操作时应戴手套。   12、 TE缓冲液:10 mmo/L Tris·Cl (),1 mmol/L EDTA ()。高压灭菌后储存于4℃冰箱中。   13、STET: mol/L NaCl,10mmol/L Tris·Cl(),10 mmol/L EDTA (), 5% Triton X-100。   14、STE: NaCl,10mmol/L Tris·Cl(),1mmol/L EDTA ()。   15、 电泳所用试剂: (1) TBE 缓冲液 (5×):称取 Tris 54g,,并加入 EDTA () 20ml,定溶至1000ml。 (2)上样缓冲液 (6×):% 溴酚蓝,40% (w/v) 蔗糖水溶液。
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操 作 步 骤
一、 细菌的培养和收集   将含有质粒菌种接种在LB固体培养基(含50μg/ml Amp)中, 37℃培养12-24小时。用无菌牙签挑取单菌落接种到5ml LB液体培养基(含50μg/ml Kan)中,37℃振荡培养约12小时至对数生长后期。
二、 质粒DNA少量快速提取   质粒DNA小量提取法对于从大量转化子中制备少量部分纯化的质粒DNA十分有用。这些方法共同特点是简便、快速,能同时处理大量试样,所得DNA有一定纯度,可满足限制酶切割、电泳分析的需要。
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(一)、煮沸法
,于8 000r/min离心1min,弃上清液。
将沉淀回溶于350μL STET ( mol/L NaCl,10mmol/L Tris·Cl(),10 mmol/L EDTA (), 5% Triton X-100。)中。
加入25μL溶菌酶(10mg/mL),放入沸水中40s,立即于10 000r/min离心10min。
吸出上清移至另一个Eppendolf 管中或用已灭菌的牙签小心地将沉淀去除,加入 ()和420μL冰冻的异丙醇,振荡混匀,室温放置5 min。
12000g,离心5min,弃上清液,用70%乙醇洗涤两次,然后将离心管倒扣在吸水纸上,使尽量干燥。
用20μL无菌水溶解沉淀,于-20℃冻存
试验步骤:
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(二)、碱裂解法
1、 eppendorf管中,4℃下10000rpm离心5min。   2、弃上清,将管倒置于卫生纸上数分钟,使液体流尽。   3、菌体沉淀重悬浮于150μl溶液Ⅰ中(需剧烈振荡),室温下放置5-10分钟。   4、加入新配制的溶液Ⅱ300μl, 盖紧管口,快速温和颠倒eppendorf管数次,以混匀内容物(千万不要振荡),冰浴5分钟。   5、加入227μl预冷的溶液