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细菌DNA的提取方法.docx

上传人:yusuyuan 2022/6/14 文件大小:18 KB

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文档介绍

文档介绍:细菌DNA的提取方法
针对一些不易于提取的细菌的方法:
试验试剂:
抽提缓冲液:
2%CTAB(W/V)2%PVPK25(w/v)(去色素)
100mMTris-HCl
25mMEDTA
10MLiCl
2MLiCl
DEDS法制备
先用10ml含适当抗生素的GBM过夜培养Delftiasp.,第二天4000rpm离心10min收集菌体,用WashingTE(50mmol/LTris-HCl,10mmol/LEDTA)洗菌体2次,之后将菌体充分悬浮在5ml1XTEg冲液中,先后加入
5mg/L的蛋白酶、10%SDS轻轻混匀后50c放置3h~5h,接着用等体积的Tris饱和苯酚抽提2次,苯酚/***仿/异戊醇抽提一次,***仿抽提一次后,乙醇沉淀DNA,用自动移液器吸管头将絮状DNA沉淀块吸附到Ep管中,70%乙醇洗2次,干燥后溶于适当1XT豉ddH2O中。
3
1)细菌培养:细菌接种于5ml液体培养基中,37c摇床(300rpm)培养过液。
2)细菌收集:取1ml培养物于EP管中,室温8000rpm离心5min,弃上清,沉淀重新悬浮于1mlTE()
中(用ddH2O也行)。
3)菌体裂解:加入6gl50mg/ml的溶菌酶,37c作用2h。再力口2mol/LNaCl50%110%SDS110跖120mg/ml的蛋白酶K3gl50c作用3h或37c过夜。(此时菌液应为透明粘稠液体)
4)抽提:菌液均分到两个EP管,加等体积的酚:***仿:异戊醇(25:24:1),混匀,室温放置5-10min。
12000rpm离心10min。抽提两次。(上清很粘稠,吸取时应小心,最好枪头尖应剪去)
5)沉淀:加倍体积的异丙醇,混匀,室温放置10min。12000rpm离心10min。
6)洗涤:沉淀用75%的乙醇洗涤。
7)抽(凉)干后,溶于50glddHO中,取2-5"电泳。作PCR模板用。
DNAEXTRACTIONPROCEDURE-GENERAL
Growcellsovernightin500mlbrothmedium.
Pelletcellsbycentrifugation,andresuspendin5ml50mMTris(pH,50mMEDTA.
Freezecellsuspensionat-20C
Addml250mMTris(pH,10mg/mllysozymetofrozensuspension,,placeonicefor45min.
Add1ml%SDS,50mMTris(pH,MEDTA,1mg/.
Extractwith6mlTris-equilibratedphenolandcentrifugeat10,(avoidinterface).Re-dothisstepifnecessary.
Addvol3MNaacetate(mixgently),thenadd2vol95%ethanol(mixbyinverting).
SpooloutDNAandtransf