文档介绍:单晶结构分析电子教案 OH H HH H HO OH O H HOHO第五章用 SHELXTL 程序进行结构分析的方法 new open copy archive delete exit edit edit .res edit .ins edit .cif edit .prp edit .lst copy .res →.ins Xl XH 一、 SHELXTL 文件 1. 文件名一般,同一结构,所有文件都用相同的名(不能超过 8个字符),只是扩展名不同 2. 两个必要文件(由 XPREP 程序产生) *.hkl 文件: 所有的衍射点,每一点一行。格式为: h k l F2 σ(F2) -4 2 -2 4 -2 2 -4 -2 -2 -4 -2 -2 ………………………………….. * .ins 文件:组成上可分成五部分 TITL 041203e in P2(1)/c CELL ZERR LATT 1 SYMM -X, +Y, -Z SFAC C H N O Co S UNIT 108 104 40 20 8 16 信息区 SIZE HTAB 2 . 8 ACTA BOND FMAP 2 PLAN 20 晶胞参数 X光波长标题空间群单胞中分子数目晶胞参数的标准偏差晶格类型对称操作码原子类型单胞中原子数目命令区可输入各种让 XS 和 XL 执行的命令 DFIX o5 c27 WGHT FVAR TEMP 25 Co1 5 = - - Co2 5 = - N1 3 = - - N2 3 = - …………………………………………………………………. 命令区 HKLF 4 END 原子表坐标、占有率、温度因子衍射点文件类型文件结束命令 res lst plt cif fcf pcf tex xs、xl、 refine 产生的文件记录 xs、xl、 refine 过程和结果的文件 XP 中做的图形文件晶体学信息文件结构因子文件晶体结构报表文件记录仪器型号、晶体外观等的文件 文件的建立和更新结构解析和精修的过程,是 ins 文件建立和不断更新的过程,这主要是下列过程实现的: xprep 、 xshell — refine 、xl、xp、 edit 、 copy SHELXTL 的主要子程序和文件*.ins *.hkl XPREP XS XL XP XCIF *.res XSHELL*.cif*.fcf *.ps *.sav *.plt *.lst *.tex *.pcf 二、常用的 XS 和 XL 指令指令 ACTA AFIX ANIS BOND BIND CONF DELU DFIX EADP 含义产生 cif文件将原子坐标强制性地固定在指定位置上, 或在指定位置上产生原子将各向同性换成各向异性精修计算键长、键角(加$H 包括 H的键长、键角) 计算指定原子对的键长、键角计算扭转角限制指定原子具有相似的位移参数限定指定原子对间的距离给两个或多个原子指定相同的