文档介绍：关于蛋白质分析与蛋白质组学
第一张，共七十张，创建于2022年，星期日
蛋白质组(proteome) 源于蛋白质(protein)与基因组(genome)两个字的结合，意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”，即包括一种细胞乃至一种在细胞内合成后的转运与定位有两种机制
翻译后转运（post-translational translocation）
共翻译转运（co-translational translocation）
二、蛋白质的定位、修饰
蛋白质的定位
第十三张，共七十张，创建于2022年，星期日
3. 生物信息学预测亚细胞定位
构建可靠的数据库，对蛋白质的亚细胞定位进行分析与预测，能加速蛋白质亚细胞定位的研究。
综合数据库（SwissProt、MIPS等）
模式生物数据库
专门的亚细胞定位数据库
二、蛋白质的定位、修饰
蛋白质的定位
第十四张，共七十张，创建于2022年，星期日
4. 蛋白质信息的提取是亚细胞定位预测的基本步骤
二、蛋白质的定位、修饰
蛋白质分选信号
蛋白质序列的氨基酸组分
蛋白质的功能域信息
序列比对信息
GO注释信息
氨基酸物理化学性质
混合性特征参数
蛋白质的定位
第十五张，共七十张，创建于2022年，星期日
蛋白质翻译后修饰（post-translational modification，PTM），即是指蛋白质在翻译中或翻译后会在个别氨基酸链上共价结合各种非肽类基团，形成翻译后修饰。
蛋白质翻译后修饰在体内是一个动态的变化过程，有效探明细胞和组织内蛋白质修饰谱的“翻译后修饰蛋白质组学”成为当今功能蛋白质组学研究的重要内容。
二、蛋白质的定位、修饰
蛋白质的修饰
第十六张，共七十张，创建于2022年，星期日
1. 蛋白质的翻译后修饰是蛋白质行使正常生理功能所必需的
蛋白质翻译后修饰过程使蛋白质结构更为复杂，功能更为完善，调节更为精细，作用更为专一。
常见的蛋白质翻译后修饰类型：磷酸化、糖基化、***化、泛素化、脂基化等。
二、蛋白质的定位、修饰
蛋白质的修饰
第十七张，共七十张，创建于2022年，星期日
二、蛋白质的定位、修饰
蛋白质的修饰
2. 质谱是鉴定蛋白质翻译后修饰的重要方法
蛋白质翻译后的修饰的解析主要采用电喷雾（ESI）和基质辅助激光解吸电离（MALDI）两种质谱技术。
质谱主要通过质量偏移（mass shift）来识别翻译后修饰蛋白。
第十八张，共七十张，创建于2022年，星期日
3. 基于质谱数据鉴定翻译后修饰的结果分析采用数据库搜索法
由质谱数据鉴定翻译后修饰肽段的主要方法分为两大类：数据库搜索法（database searching）和从头测序法（DeNovo sequencing）。
常用的数据库搜索法有SEQUEST、Mascot、X!Tandem、MS-Align等。
二、蛋白质的定位、修饰
蛋白质的修饰
第十九张，共七十张，创建于2022年，星期日
4. 生物信息学预测和鉴定方法有助于蛋白质翻译后修饰的研究
生物信息方法的介入，能够从序列和质谱两个角度帮助大规模鉴定翻译后修饰，有助于翻译后修饰蛋白质组学研究的迅速发展。
二、蛋白质的定位、修饰
蛋白质的修饰
第二十张，共七十张，创建于2022年，星期日
5. 基于序列法是预测蛋白质翻译后修饰的重要生物信息学方法
同类翻译后修饰位点周围的片段往往都具有很强的序列保守性，通过对常见翻译后修饰的数据的收集，及对发生同类修饰的蛋白序列特征的研究如保守motif，从而能够基于序列预测翻译后修饰。
二、蛋白质的定位、修饰
蛋白质的修饰
第二十一张，共七十张，创建于2022年，星期日
1. 蛋白质相互作用是细胞进行一切代谢活动的基础
生命的基本过程就是不同功能蛋白质在时空上有序和协同作用的结果。
细胞各种重要的生理过程，包括信号转导、细胞对外界环境及内环境变化的反应等，都是以蛋白之间相互作用为纽带，并形成网络。
二、蛋白质的定位、修饰
蛋白质的相互作用
第二十二张，共七十张，创建于2022年，星期日
2. 蛋白质的特定结构域是介导蛋白质-蛋白质间相互作用的基础
典型蛋白质相互作用的结构域是一个具有结合专一性的独立折叠元件，可以插入新的蛋白质中并保留结合靶部位的能力。
它们的相互作用多是通过 2个多肽表面几何构型和静电力而相互连接。
二、蛋白质的定位、修饰
蛋白质的相互作用
第二十三张，共七十张，创建于2022年，星期日
3. 实验方法是鉴定蛋白质-蛋白质间的相互作用的主