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单细胞测序技术在膀胱癌研究中的应用与展望.pdf

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文档介绍

文档介绍:356 J Mod Urol,Vol. 27 No. 4 Apr. 2022
·综 述·
中的突变频率中排列第三 [1 2] 。临床上按照肿瘤浸 肿瘤方面的应用,阐述 SCS 在 BC 中的研究进展。
润 膀 胱 壁 深 度 可 以 分 为 非 肌 层 浸 润 性 膀 胱 癌(non
1 单细胞测序技术的发展和应用
muscular invasive bladder cancer,NMIBC)、肌层浸润
性膀胱癌(muscular invasive bladder cancer,MIBC)。 单 细 胞 RNA(转 录 组)测 序 技 术(single cell se⁃‐
-
根据分子分型可分为管腔型、基底型和鳞状型 [3] 。虽 quencing, scRNA seq)在 2009 年 首 次 出 现 ,开 启 了
然 新 一 代 测 序 技 术(next generation sequencing, SCS 发展的时代 [5] 。随后的十几年里,相继出现了单
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NGS)已 广 泛 地 展 示 了 BC 的 基 因 表 达 图 谱 ,但 这 只 细胞 DNA(基因组)测序 [6] 融合 DNA RNA 的多种模
是肿瘤样本在某一时段的总体批量分析,反映的是整 式单细胞测序 [7] 以及采用微流控液滴法,筛选与带有
体混合细胞的平均表达谱 [3] ,掩盖了不同群体细胞的 条形码(barcode)、分子标签(unique molecular index,
差 异 特 征 ,忽 略 了 某 些 基 因 的 随 机 性 表 达 [4] ,从 而 限 UMI)、引物及酶的凝胶珠(Gel Beads)相结合的单个
制了对 BC 机制的深入研究。对于具有高度异质性的 细胞测序技术,能够在短时间内同时分析数千个单细
BC 细胞,单细胞测序(single cell sequencing,SCS)技 胞中 mRNA 表达和扩增建立文库的单细胞 RNA 测序