第三篇生物信息学资源与数据挖掘工具.ppt

文档介绍：第三章生物信息学资源与数据挖掘工具
一、国外重要生物信息中心
NCBI
美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information)
前身是NIH所属的一个研究所的计算生物学研究室,1988年独立为NCBI,形式上属于国家医学图书馆(National Library of Medicine/NLM)
管理着许多著名数据库,如GenBank、Medline、dbSNP、COG、OMIM等
提供Entrez、BLAST等服务
.gov
EBI
欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatics Institute)
1994年建于英国剑桥,前身是德国海德堡的欧洲分子生物学实验室的信息服务部门
EBI接收了原来EMBL数据库的管理和维护
是欧洲分子生物学网()的一个特别节点
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NIG
日本国立遗传学研究所(National Institute of ics)
创立于1949年7月1日,属文部省管辖
信息服务始于1984年
维护管理着DDBJ
1987年1月发行DDBJ第一版
其他重要中心
HHMI (Howard Hughes Medical Institute) [美]
MIPS (Munich Information Center for Protein Sequences) [德]
SIB (Swiss Institute of Bioinformatics) [瑞士]
SWISS-PROT, ExPASy, ENZYME, …
NCGR [美], JIPID [日], HGMP[英], BioBase [丹], …
二、数据库目录
NAR数据库专辑
从1994年开始,《核酸研究》杂志(Neucleic Acids Research)每年第一期是生物数据库专辑
每个专辑大约介绍100多种库
从2000年起,该杂志的出版社(牛津大学出版社)设立了一个数据库目录网页
其他数据库列表
NIH全球数据库列表

CBI的生物数据库镜像列表
.cn/help/
三、常用序列格式