文档介绍:柱离心法小量提取质粒 DNA 及 DNA 的琼脂糖凝胶电泳
实验目的和要求:
1、了解质粒 DNA 的应用,并学习用柱离心法小量提取质粒 DNA。
2、掌握 DNA 琼脂糖凝胶电泳的方法。
实验原理:
质粒是细菌中独立于染色体之外柱离心法小量提取质粒 DNA 及 DNA 的琼脂糖凝胶电泳
实验目的和要求:
1、了解质粒 DNA 的应用,并学习用柱离心法小量提取质粒 DNA。
2、掌握 DNA 琼脂糖凝胶电泳的方法。
实验原理:
质粒是细菌中独立于染色体之外的较小的环状双链DNA,它通常携带某种 药物(如氨苄青霉素,卡那霉素,链霉素,四环素等)的抗性基因,具有独立的 复制原点,并且具有较高的拷贝数(从几个到几百个不等)。
柱离心法首先用碱使大肠杆菌裂解,并使其中的DNA (包括质粒及细菌的 染色体DNA)全部变性。再用酸性缓冲液中和,质粒DNA由于分子较小,很快 复性,而染色体DNA分子巨大,几乎不能复性,最后和细胞碎片及膜蛋白共沉 淀被离心去除,上清液中含有复性的质粒DNA,蛋白质,RNA,并且盐浓度较 高。在这种条件下,质粒DNA能够牢固地结合在离心柱中的吸附基质上,而大 多数蛋白质和 RNA 在离心时被穿过,残留在吸附基质上的少量蛋白质和 RNA 可以用漂洗液洗去,最后,吸附在离心柱上的质粒DNA用低离子强度的溶液或 水洗脱。
与蛋白质相比, DNA 的分子量通常要大得多,必须用孔径较大的琼脂糖凝 胶介质进行分离。
在理想的电泳条件下,具有相同构型的DNA的电泳迁移率和它们分子量的 对数成线性关系,分子量相同的质粒DNA的电泳迁移率和它们的构型有关,由 快到慢通常为超螺旋,线性,开环和复制中间体(连环体)。
DNA 限制性内切酶可以从内部切割环状或线状双链 DNA,II 型 DNA 限制 性内切酶具有固定的识别位点和切割位点,它们可以在特定位点以特定方式切割 质粒DNA,并且产生有固定序列及形状的末端。因此,它们在重组DNA技术中 具有重要作用。
实验材料:
含质粒的大肠杆菌DH5a; LB+Amp培养基(配方参照《分子克隆》除非 特别说明,以下同);柱离心质粒小量制备试剂盒(博大泰克公司);质粒 DNA (PUC18-G);电泳用琼脂糖;TAE缓冲液;goldview荧光染料;6x DNA上样 buffer;限制性内切酶 EcoRI (10 U/pl, G'AATTC); Hindlll (10 U/pl, A'AGCTT); 10x buffer R。
实验方法:
1.将带有质粒的大肠杆菌单克隆接种到 ml 含有相应抗生素的液体培养基,
37°C振荡培养12〜16小时;
ml过夜菌转移至Eppendorf管中,10000 rpm( r/min)离心1 min,用水泵 吸干培养基上清液,加入100山溶液1(含RNaseA),充分混匀;
加入150山 溶液II,加盖颠倒6-7次使之混匀,室温放置1〜2min;
加入150卩l溶液III,加盖后颠倒6-7次混匀,室温放置5min;
用台式高速离心机, 12000 rpm 离心 10min;
吸附柱中加入 420 pl 结合缓冲液,将步骤5 中的上清转移至吸附柱中,盖上
收集管的盖子,混匀, 12000 rpm 离心 1 min;