文档介绍:A计算机辅助药物设计ppt(宫)
高通量药物筛选
以药物作用靶点(包括酶、结构和通道蛋白、基因等)为主要对象的细胞和分子水平的筛选模型,根据样品与靶点结合的表现,判断化合物的生物活性。并可以进一步预测药物的三维空间构象,药物的毒性以A计算机辅助药物设计ppt(宫)
高通量药物筛选
以药物作用靶点(包括酶、结构和通道蛋白、基因等)为主要对象的细胞和分子水平的筛选模型,根据样品与靶点结合的表现,判断化合物的生物活性。并可以进一步预测药物的三维空间构象,药物的毒性以及制定合理有效的药物合成方法。
高通量筛选的新技术
计算机技术
在高通量药物筛选中,几乎全部过程都与计算机技术密切相关,如样品的管理,操作过程的控制,筛选结果的分析和处理等等。计算机辅助筛选的基本方法是根据药物作用靶点与药物小分子结合的原理,通过结构模拟、立体结构对接、分子间能量计算、分子相互作用力的预测等手段,寻找能够与特定药物作用靶点相互作用的小分子结构,作为药物研究的对象。
生物芯片技术
生物芯片技术是随着人类基因组研究的进展,在最近几年出现的高新技术。由于该项技术可以在有限的空间和实验条件下获得极为大量的生物信息,使研究工作的效率得到极大的提高,受到科学界的重视。生物芯片包括基因芯片、蛋白芯片、细胞芯片、组织芯片等。
计算机辅助药物设计相关软件介绍
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创腾科技有限公司简介
基于靶标的药物设计流程
确定靶标
寻找先导化合物
R基修饰
药效基团模型
动物实验
三维构效关系
分子对接
活性预测
毒性预测
化学合成
InsightII提供分子建模与模拟的专业工具,是一个三维图形环境软件包,它集成了分子建模工具、开发工具、力场、模拟和显示工具,以及为生命科学的应用而特别开发的工具,帮助研究人员全面了解生物分子的结构与功能。它在蛋白质结构功能关系、生物分子模拟与计算、基于靶标结构的药物设计、生物分子核磁共振、抗体设计、教学、功能基因组以及蛋白质组等领域有着广泛的应用。
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化学合成
Catalyst 是美国Accelrys公司开发的面向药物研究领域的综合性的药物开发软件。Catalyst通过确立正确的药效基团模型,并利用这一药效基团模型及来自受体的信息形成约束条件,对Catalyst所管理的化合物数据库进行检索。药效基团模型可对检索得到的化合物的活性进行预测和评价,最后帮助研究人员找到合乎要求的先导化合物。
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化学合成
在合成和购买之前先通过计算机工具分析和预测,找到最有可能具有活性的化合物,已成为加速药物发现过程的关键步骤。Tsar作为一个桌面上的QSAR(定量构效关系)分析软件,不但可以在新药发现的各个阶段起到至关重要的作用,同时它易于使用的化学表格的界面可以被药物化学家、计算机化学家以及组合化学家等各方面专家所接受。
Tsar的组成
Tsar:一个整合的2D-QSAR软件包,通过使用统计和可视化分析的方法找到数据的内在联系。
Tsar-3D:一个整合的3D-QSAR软件包,在原有的2D处理方法上加入了以下功能:2D-3D的转换;3D结构的优化;量化参数以及三维结构相似性比较。
TsarBatch:由于批量处理大量的结构信息。
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