文档介绍:琼脂糖凝胶电泳检测dna
【四】仪器、材料与试剂
质粒样品、酶切样品和PCR样品。
凝胶电泳系统和电泳图像分析系统(凝胶成像系统)等。
琼脂糖、 1XTBE电泳缓冲液、溴化乙锭、 6X载样缓冲液 ( 6X loading buf琼脂糖凝胶电泳检测dna
【四】仪器、材料与试剂
质粒样品、酶切样品和PCR样品。
凝胶电泳系统和电泳图像分析系统(凝胶成像系统)等。
琼脂糖、 1XTBE电泳缓冲液、溴化乙锭、 6X载样缓冲液 ( 6X loading buffer)和DNA分子量标准( Lambda DNA / EcoRI + HindIII Marker )等。
凝胶电泳系统
DYY-6C型  双稳定时电泳仪电源(北京六一) 输出范围(显示分辨率):6-600V(1V)      4-400mA (1mA)      240W
美电泳槽Mini-Sub Cell GT Cell
凝胶成像分析系统
Lambda DNA / EcoRI + HindIII Marker(Ferments)
一个已知分子质量的DNA样品做最对照,用来确定待测样品的相对分子质量。
常用电泳缓冲液
缓冲液
缓冲容量
迁移速度
分辨率
用途
TAE
最低
最快
(高10%)
高分子量高
高度复杂DNA混合物;超螺旋DNA
TBE
很高
较慢
低分子量高
价格昂贵,不常用
TPE
电泳指示剂溴酚兰在碱性液体中呈紫兰色,一般与蔗糖、甘油或聚蔗糖400组成上样缓冲液。
作用:
①增加样品比重,以确保DNA均匀沉入加样孔内。
②形成肉眼可见的指示带,预测核酸电泳的速度和位置。
③使样品呈色,使加样操作更方便。
上样缓冲液
溴化乙锭
溴化乙锭( 3,8-二氨基-5-乙基-6-苯基菲啶溴盐Ethidium Bromide,EB),EB染色(EB可很好地掺入到双链DNA中),在紫外光下会发出橙红色的荧光,用于对DNA进行染色和观察。
用于观察的紫外光有3种波长,一般使用中波紫外光(302nm)。
短波紫外光(254nm)观察效果较好,但对DNA的破环很大。
长波紫外光(366nm):回收。
EB染料优点:染色操作简便,快速,室温下15-20min;不会使核酸断裂;灵敏度高,10ng或更少的DNA即可检出;可以加到样品中或胶中。
EB是诱变剂,使用时一定要戴手套。 EB废液要经过处理才能丢弃。
SYBR:新型低毒,高灵敏度染料,加入样品中,价格较昂贵。
【五】实验步骤
制备琼脂糖凝胶(1%)
制备凝胶板
加样
电泳
染色
结果观察
(1)制备凝胶和胶板:
45ml(1×TBE)+( 三角瓶 ), 煮胶,溶解,冷却至60℃(不烫手),倒板(4-6mm),室温下充分凝固,竖直拔下梳子 。
胶板设计(44人):
每18孔胶板(5人X3样品+1marker),8胶板
每8孔胶板(2人X3样品+ 1marker ),2胶板
(2 )加样:
5μl质粒DNA+1μl loading buffer ,混匀
15μlPCR产物+3μl loading buffer,混匀
10μl酶切产物+2μl loading buffer,混匀
6μlDNAMark (每板胶加一孔)
(3 )电泳:电压3-5V/cm,约80-90V,注意电极方向
(4 )染色:EB染色约15min
(5 )观察:紫外透射分析仪下观察。
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