文档介绍：摘要有非常广泛的宿主范围,在世界各地都有分布。青枯菌是植物病害分子机理研究我们应用、!7治鼋峁砻鳎嗫菥://..甤痶刑峁┓瘢梢宰杂煞梦省T诖耸菘庵校头泌系统的结构蛋白和细菌的鞭毛蛋白都根据其直系同源关系分类显示,每一个蛋白质都有如下信息:基因名称、物种来源、基因限定、分类、基因序列、蛋白质序列等。部分蛋白质的三维结构信息列于趁嬷胁⑻峁┟夥严略亍6遥我们对青枯菌及另外五种高含量的革兰氏阴性植物致病菌进行了基因的预测高表达治觥F渌【ǜ┩寥栏司⑹只ǹ坪诟【⒌毯草黄单胞菌、丁香假单胞杆菌、苛养木杆菌。结果显示,能量代谢途径中的酶中是预测高表达的,这与苛养木杆菌兼营厌氧和需氧发酵有关。大多数毒力相关达基因。三型分泌系统结构蛋白虽然与鞭毛蛋白具有一定的同源性,但不是预测高表达基因,这说明三型分泌系统结构蛋白与鞭毛蛋白在进化上是相互分离的。在病菌侵染过程中,它们利用微妙的代谢调控机制将自身从自由生存状态转变为宿主依赖模式,其间病菌的毒力因子起了关键作用。处于侵染过程中的病菌青枯菌且恢治:ρ现氐耐链参镏虏【中的一个重要的模式生物。分析。青枯菌基因组大小为,具有高的含量,它包括两个复制子:一两个复制子都具有外源基因嵌合现象,这也是基因水平转移的一个证据。为了分析青枯菌的三型分泌系统,我们构建了一个包含大部分革兰氏阴性菌三型分泌系统蛋白质的数据库,名为三型分泌系统数据库T谕荆用户可以通过页面自由搜索任意记录的蛋白质信息,通过趁嬗萌意的蛋白质或核酸序列进行榷运阉鳌类,如铣擅负腿人嵫分械母髦忠蜃釉诔裂靖司獾钠渌妇因子,包括鞭毛蛋白和部分外膜蛋白,除了苛养木杆菌不具备鞭毛外都属于高表另外,一些特定的生物合成酶类是预测高表达的,如鞍椎取可以根据不同的环境信号改变生物指令,从而改变毒力因子的表达。我们分析了
青枯菌及其它各类细菌的毒力因子作为药物靶点的可行性,这在新型药物设计中具有重要意义。关键词:青枯菌;基因组分析;植物致病菌;预测高表达颍灰┪锷分类号:计Ⅱ
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荪锄导师肄劾锄学位论文作者签名:/幼前学位论文作者签名:榭雷独创声明学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解堂撞有关保留、使用学位论文的规定,有权保留并成果。据我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅。本人授权堂控可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、签字日期:年麓谌本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得ⅲ喝缑挥衅渌枰特别声明的,本栏可空蚱渌逃沟难换蛑な槭褂霉牟牧稀S胛乙煌ぷ的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。导师签字:缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。C艿难宦畚脑诮饷芎笫视帽臼谌书签字日期:年日,。‘
第一章引言国内外研究的现状和发展趋势青枯菌简介侵染过程以及致病机理进行深入的研究,以期找到一种治疗青枯病的有效方法,进行深入研究,以期获得青枯菌与宿主植物之间识别、侵染及其病理过程的微妙山东师范大学硕士学位论文一青枯菌基因组分析青枯菌窃谌蚍段谠斐裳现匚:Φ闹匾V参锊原细菌,可侵染多个科的嘀种参铮ㄇ芽谱魑铩⒀滩荨⒅ヂ椤⒒ㄉ大豆、萝榷嘀峙┳魑镆约按蠓段У牧忠凳髂荆鞘澜缟戏植甲罟恪⑽:ψ钪且最难防治的重大细菌性病害】。青枯菌是一种土传病菌,它从植物根部或茎部伤口侵入,进入维管束组织后扩展,造成导管堵塞,整个输管器官被破坏而失去功能,从而干扰代谢,影响水分运输,植物茎叶由于得不到水分的供应而萎蔫。目前国际上对青枯病菌尚无有效的杀菌剂进行治疗,现有的防治手段是以预防为主,主要是生物防治方面入手,早期藤井薄试用噬菌体防治番茄青枯病未能获得成功,孟宪曾用放线菌乐位ㄉ嗫莶∮幸欢ǖ男Ч诟=ㄅ┛院研究员刘波博士正在做农作物青枯病生防菌难芯浚〉昧艘定的进展。大部分用于青枯病生物防治的因子主要是无致病力的青枯假单胞菌和其它有益微生物,但是效果一直不好,鉴于此,我们有必要对青枯菌的毒力因子、解决植物病害防治的一大难题。生物信息学在近十年内突飞猛进,发展出一系列研究方法,对于基础生物学的理论和实践研究起了巨大的推动作用,利用生物信息学方法对微生物基因组的研究己取得了一定的成果,因此,我们利用生物信息学方法,对青枯菌基因组、蛋白质序列、三维结构以及它们之间的相互调控关系信息,从而在植物病理和新型农药开发方面做出一定的贡献。.嗫菥掷嘌У匚青枯菌属于革兰氏阴性菌,它在生物分类学上的地位如下:界合妇:变形细菌纲阂倚捅湫