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SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳1.ppt

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SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳1.ppt

上传人:小落意 2022/8/21 文件大小:2.59 MB

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SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳1.ppt

文档介绍

文档介绍:SDS-聚丙烯酰***凝胶电泳1
适用于教师试讲、学校演讲、教学课件、说课大赛
一、什么是SDS?
十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,SDS)
是一种阴离子去污剂。它在水溶液中以单体
(monomer)和分SDS-聚丙烯酰***凝胶电泳1
适用于教师试讲、学校演讲、教学课件、说课大赛
一、什么是SDS?
十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,SDS)
是一种阴离子去污剂。它在水溶液中以单体
(monomer)和分子团(micellae)的混合形
式存在。
SDS的作用
破坏蛋白质分子之间以及其他物质分子之间的非共价键,使蛋白质变性而改变原有的构象,保证蛋白质分子与SDS充分结合而形成带负电荷的蛋白质-SDS复合物。
一、SDS-PAGE的基本原理
(一)蛋白质分子的解聚 样品介质和聚丙烯酰***中加入离子去污剂和强还原剂后,蛋白质亚基的电泳迁移率主要取决于亚基分子量的大小,而电荷因素可以被忽略。
1、SDS 阴离子去污剂 变性剂 助溶性试剂 断裂分子内和分子间的氢键 分子去折叠 破坏蛋白质分子的二级和三级结构
2、强还原剂 巯基乙醇(β-mercaptoethanal) 二硫苏糖醇(dithiothreitol,DTT) 使半胱氨酸残基之间的二硫键断裂。
SDS和还原剂的作用: (1)分子被解聚或组成它们的多肽键 (2)氨基酸侧链与SDS充分结合形成带负 电荷的蛋白质-SDS胶束。 (3)蛋白质-SDS胶束所带的负电荷大大超 过了蛋白质分子原有的电荷量,消除 了不同分子之间原有的电荷差异。
蛋白质-SDS胶束的特点 (1)形状像一个长椭圆棒 (2)短轴对不同的蛋白质亚基-SDS胶束基本上是相同的。 (3)长轴的长度则与亚基分子量的大小成正比。
(三)凝胶浓度的选择 由于SDS电泳分离并不取决于蛋白质的电荷密度,只取决于分子解聚后SDS-蛋白质胶束的大小,因此凝胶浓度的选择会直接影响分辨率。 不同分子量范围的蛋白质应选用不同的凝胶浓度.
(四)分子量测定 1、相对迁移率(Rf) Rf即用每个带的迁移距离除以溴酚蓝前沿的迁移距离得到的。 测量位置应在蛋白带的中央。 蛋白带迁移距离 Rf= ———————— 溴酚蓝迁移距离
蛋白带迁移距离 固定前的凝胶长度 Rf= ————————— X ————————— 干燥后的凝胶长度 溴酚蓝迁移距离
2、作图 以已知蛋白质分子量的常用对数值为纵坐标,Rf为横坐标绘图
3、通过测定未知蛋白质的Rf值,便可在标 准曲线上读出他的分子量
二、去污剂的选择 无离子去污剂:Lubro W;Brij35, Tween Triton 阳离子去污剂:cetyltrimethyl ammonium bromide (CTAB) cetylpyyridinium (CPC) 阴离子去污剂:SDS deoxycholate
三、方法 1、分类 (1)根据对样品的处理方式的不同 还原SDS电泳 非还原SDS电泳 带有烷基化作用的还原SDS电泳
(2)根据缓冲系统和凝胶孔径的不同 连续电泳 不连续电泳 (3)根据电泳的形式 圆盘电泳 垂直电泳 平板电泳 水平电泳
2、操作 (1) 制备分离胶 (2) 制备积层胶(堆积胶)
分离胶聚合之后
(3) 加样品 样品的处理 在蛋白溶液中加入过量的SDS后,可引起以下的反应: 蛋白质本身的电荷被屏蔽 氢键断裂 疏水相互作用被取消 多肽被去折叠(二级结构破坏),并形成椭球形
①还原SDS处理 当加入还原试剂DTT或β-二巯基乙醇后,蛋白质被完全去折叠,只根据分子量分离。
②带有烷基化作用的还原SDS处理