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() 2022,Apr;41(2):241-245
JSoutheastUniv(MedSciEdi)·241·
·论著·

BIRC5在三阴乳腺癌中的表达及其临床意义
王一晴1曾冬阳1龚智逊2王雅阁1杨作磊3
,,,,
海南医学院研究生院海南海口海南医学院第二附属医院放疗科海南海口
(1., 571199;2., 570311;
海南医学院第二附属医院甲乳外科海南海口
3., 570311)
摘要目的寻找预后不良的三阴乳腺癌潜在的预后分子标志物方法从数据库下载
[]:(TNBC)。:GEO
的基因表达谱该微阵列由个非和个共个样本组成综合分析所有P
GSE76275。67TNBC198TNBC265。<
和倍数变化或的差异表达基因结果鉴定出个上调基因和个下调基因并
≥1≤-1(DEG)。:138210,
进行基因本体论京都基因与基因组途径百科全书富集分析这些基因主要参与细胞增殖
(GO)、(KEGG)。、
蛋白水解蛋白质同源二聚化活性钙离子结合序列特异性结合细胞周期和信号通路的生物
、、、DNA、PPAR
学过程利用蛋白质相互作用网络鉴定了个中枢基因利用进一步进行生存分析筛选出
。10,GEPIA,BIRC5
为的预后关键基因结论鉴定出的这些途径和基因可以帮助理解的发展机制可能是
TNBC。:TNBC;BIRC5
治疗的潜在靶点
TNBC。
关键词三阴乳腺癌预后标志物
[];;BIRC5
中图分类号文献标志码文章编号
[] []A []1671-6264(2022)02-0241-05
doi:.1671-
ExpressionandclinicalsignificanceofBIRC5intriple-negative
breastcancer
WANGYiqing1ZENGDongyang1GONGZhixun2
,,,
WANGYage1YANGZuolei3
,
.
(1,,571199,;2,
theSecondAffiliatedHospitalofHainanMedicalCollegeHaikouChina
,570311,;
.DepartmentofThyroidandBreastSurgerytheSecondAffiliated
3,
HospitalofHainanMedicalCollegeHaikouChina
,570311,)
AbstractObjective
[]:Tofindpotentialmolecularprognosticmarkersfortriple-negativebreastcancer(TNBC)
Methods
withpoorprognosis.:
microarrayconsistedof265samples,including67non--
PResults
entiallyexpressedgenes(DEG)with<≥1or≤-1wasperformed.:Onehun-
dredandthirty-eightup-regulatedgenesand210down-regulatedgeneswereidentified,andgeneontology(GO)
andKyotoEncyclopediaofGenesandGenomePathways(KEGG)
收稿日期修回日期
[]2021-08-18 []2021-12-08
基金项目海南省卫生计生行业科研项目
[](20A200399)
作者简介王一晴女四川南充人在读硕士研究生
[](1996),,,。E-mail:******@
通信作者曾冬阳
[万方数据] E-mail:******@
引文格式王一晴曾冬阳龚智逊等在三阴乳腺癌中的表达及其临床意义东南大学学报医学版
[],,,.BIRC5[J].(),2022,41(2):241-245.
东南大学学报医学版年月
·242·() 20224,41(2)
weremainlyinvolvedinthebiologicalprocessesofcellproliferation,proteolysis,proteinhomodimerizationactivity,
calciumionbinding,sequence-specificDNAbinding,-
tionnetworkwasusedtoidentify10centralgenes,
Conclusion
screenedoutasakeyprognosticgeneforTNBC.:Theidentifiedpathwaysandgenescanhelpunderstand
.
Keywords
[]triple-negativebreastcancer;prognosticmarkers;BIRC5
三阴乳腺癌是指不表达雌激素受体分子功能探索生物学意义通过输入的基因名称
(TNBC);DEG
孕激素受体和人表皮生长因子受体并导出结果P版用于分析
(ER)、(PR)2(<);David()
基因的乳腺癌[1]它占美国所有乳腺癌途径
(Her2/neu)。KEGG。
的且预后不良[2]缺乏这些受体的表达PPI网络构建
15%~20%,。
使得治疗变得更加困难因为它通常需要联合治疗[3]用于评估信息通过
,。STRING()PPI。Cyto-
由于缺乏新靶点常规化疗是临床上使用的主要治疗版本的进行中枢基因的鉴定
,。
方法但结果并不理想[4]生存分析
,。
目前的研究普遍认为异质群体在临生存分析使用总体生存的计算使
,TNBCsKaplan-Meier。
床[5-6]组织学[7-8]分子水平[9-12]有着异质性近期有用来自数据库的数据集进行生存分析所有
、。GEPIA。
研究利用基因组拷贝数阵列信使阵列外设置均为默认值个中枢基因都进行了生存分析
DNA、RNA、。10,
显子测序***化微小测序蛋白最终呈现其中P的基因
、DNA、RNA(miRNA)、<。
质阵列等技术阐明的亚型和分子机制并将数
TNBC,
据存入等公共数据库结果
GENEEXPRESSIONOMNIBUS,2
认为这些数据证实了临床行为的异质DEG的鉴定
Atlas(TCGA)
性[13]此外这些公共数据集为从不同角度调查总共鉴定出个上调基因和个下调基因
。,TN-138210
的分子机制提供了可能性因此深入了解共个见图
BC。TNBC
的分子模式有助于制定治疗癌症的新策略(348),1。
。
本研究通过比较来自和非患者样本
TNBCTNBC
的基因表达谱来鉴定差异表达基因随后将这
(DEG),
些基因进行基因本体论京都基因与基因组学百
(GO)、
科全书途径分析同时进行蛋白质蛋白质相
(KEGG),-
互作用网络和中枢基因的筛选最后分析基因
(PPI),
表达与生存之间的相关性这些数据可能有助于进一
。
步了解并探索其诊断预后和发现药物治疗的
TNBC,、
潜在靶点
。
资料与方法
1
微阵列数据

基于平台由个样本包括
GSE76275GPL570,265
个非和个的基因表达数据组成
67TNBC198TNBC。
DEG的鉴定

的包用于鉴定与非样本
R“limma”TNBCTNBC
之间的丨丨P的图1 所有基因的火山图 横轴为变化倍数纵轴为P值得变
DEG(logFC≥1,≤);R“heat-,
包用于绘制所有基因表达的火山图及前个化倍数横轴零点右侧的点代表上调基因虚线右侧代表变化
map”,100;,
的表达热图倍数大于横轴零点左侧的点代表下调基因虚
DEG。Log2(FC)>,,
基因富集分析线左侧代表变化倍数大于
Log2(FC)<-
通过万方数据术语富集分析生物学过程细胞成分和
变化倍数⒁诲膓一崾—GO、、
王一晴等在三阴乳腺癌中的表达及其临床意义
,.BIRC5·243·
基因富集分析

所有显著改变的基因都被提交到
David(
版对于生物过程在细胞增殖的正调
)。(BP),DEGs
控蛋白水解和细胞增殖显著富集对于细胞定位
、。
多定位于细胞外外泌体细胞外空间和胞
(CC),DEGs、
外区而对于分子功能显著富集蛋白质
。(MF),DEGs
同源二聚化活性钙离子结合和序列特异性结
、DNA
合分析显示这些基因主要参与细胞周期和
。KEGG,
信号通路见表
PPAR。1。
表1 GO和KEGG富集通路
种类项目计数百分比P值

图2 cytohubba插件计算出排名前10的中枢基因 排
细胞增殖的CDC20
序第一逆时针降序排列
-05,
生物过程
蛋白水解

细胞增殖
-04
胞外外泌体
-06
细胞定位细胞外间隙
-05
胞外区

蛋白质同二
-04
activity
分子功能钙离子结合
-04
序列特异性

DNA
细胞周期

信号通路

PPI网络的构建图3 BIRC5在GEPIA中的生存预测表现

将都提交给生成网络基于
DEGsSTRING,PPI。
网络通过软件的插件计算出定了与非样本患者之间的并进行
PPI,cytoscapecytohubbaTNBCTNBC/DEG,
排名前的差异基因见图了网络通路之间的相互关系和生存分析
10,2。GO、PPI、。
生存分析总共列出个上调基因和个下调基因P
138210,<
使用乳腺癌数据库中的乳腺癌数据集对且倍数变化或基于这些进行了生物
GEPIA≥1≤-1。DEG,
前个中枢基因进行生存分析结果显示只有信息学分析
10,BIRC5。
具有预后判断意义见图首先细胞成分富集分析表明这些主要位
,3。,DEGs
于细胞外的外泌体和细胞外区域细胞外囊泡
讨论。“”
包括几种类型的囊泡这些囊泡与耐药性增殖
3 (EV),、
肿瘤研究是疾病研究中表达谱基因芯片应用最多增加侵袭性和癌症诱导的免疫抑制有关[20]其次
、。,
的领域[14-15]基因表达谱芯片为分析肿瘤和正常组分子功能富集分析表明主要促进序列特异性
。,DEGs
织之间的基因差异和寻找新的肿瘤标志物提供了强大结合和蛋白质同源二聚化活性特异性结
DNA。DNA
的工具[16]它对筛选用于肿瘤分类和分型的遗传标记合是后续转录的起始和延伸所必需的然而在
万方数据;;TNBC
以及药物治疗的潜在目标至关重要[7,17-19]本研究确的临床前模型中该过程的抑制会导致细胞死亡[21]
姆他酬。,。
东南大学学报医学版年月
·244·() 20224,41(2)
最后生物过程富集分析表明主要参与细胞增
,,DEGsp-VEGFR2/VE-cadherin/beta-catenin/actincomplexpro-
殖和蛋白水解接下来在研究中分析了的网络
。DEGmotesmicrovesselnormalizationandsuppressestumorprogres-
和核心基因排名前的基因又进行生存分析最终
,10,sion[J].JExpClinCancerRes,2019,38(1):285.
筛选出为唯一的预后判断核心基因
BIRC5。[8]HAMMONDME,HAYESDF,DOWSETTM,
是许多癌症信号通路的交叉点其功能由societyofclinicaloncology/collegeofAmericanpathologists
BIRC5,
构成上游信号通路的许多上游细胞信号分guidelinerecommendationsforimmunohistochemicaltestingof
BIRC5
子[22]控制和调节上游分子包括结合蛋白蛋白调节estrogenandprogesteronereceptorsinbreastcancer[J].JOn-
。、
剂各种酶蛋白酶激酶磷酸酶转录因子colPract,2010,28(16):2784-2795.
、(、、)、、miR-
转运和通道蛋白以及受体具有或不具有激酶活[9]REIS-FILHOJS,:acrit-
NA、,-
性[23-24]使用作为靶点未来与药物发现及癌icalreview[J].Histopathology,2008,52(1):108118.
。BIRC5,-
症治疗相关的转化研究正在蓬勃展开[25-26][10]GONZALEZANGULOAM,TIMMSKM,LIUS,-
。
本研究对与非的基因表达谱进行了denceandoutcomeofBRCAmutationsinunselectedpatients
TNBCTNBC
综合分析并确定了一些参与发病机制的关键withtriplereceptor-negativebreastcancer[J].ClinCancer
,TNBC
基因这些发现可能会在系统水平上提供对发Res,2011,17(5):1082-1089.
。TNBC---
病机制的见解并为患者确定一些替代生物标[11]GODOYORTIZA,SANCHEZMUNOZA,CHICAPARRA-
,TNBCDOMR,:bio-
志物和潜在的治疗靶点应该对这些关键基因进行持
。logicalandclinicalimplications[J].FrontOncol,2019,9
续研究以阐明它们在中的详细作用
,TNBC。(10):1124.
参考文献[12]VOUTILAINENS,HEIKKILAP,SAMPOM,
[]ofmarkersofstemcellcharacteristics,epithelial-mesenchymal
[1]HUOXF,SHENGS,LIUZ,,basal-likephenotype,proliferation,andandrogenre-
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() 2022,Apr;41(2):245-259
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·论著·

基质金属蛋白酶3在舌鳞状细胞癌中的
表达及其临床意义
袁硕1高炳菊2李斌1仝越越1
,,,
东南大学附属中大医院口腔科江苏南京福建医科大学附属第一医院
(1., 210048;2.
口腔颌面外科福建福州
, 350004)
摘要目的探讨基质金属蛋白酶在舌鳞状细胞癌及其配对癌旁组织中的表达及其临床病理学
[]:3(MMP3)
意义方法收集病理证实为舌鳞状细胞癌患者的术后标本例采用实时荧光定量聚合酶链反应检测癌
。:49,
组织及其配对癌旁组织中的表达情况并结合临床信息分析其意义另外利用生物信息学技术在
MMP3,。
公共数据库中挖掘的表达情况分析其对患者预后的意义并进行功能富集分析
TCGAMMP3,(GSEA)。
结果癌组织中的表达高于癌旁组织P高表达促进舌癌的淋巴转移并与患者较差的
:MMP3(<);MMP3,
预后有关结论在舌癌的发生发展中起重要作用可能为舌癌治疗的靶向分子
。:MMP3,。
关键词舌鳞状细胞癌基质金属蛋白酶靶向治疗
[];3;
中图分类号文献标志码文章编号
[] []A []1671-6264(2022)02-0245-05
doi:.1671-
Expressionandclinicalsignificanceofmatrixmetalloproteinase3
intonguesquamouscellcarcinoma
YUANShuo1GAOBingjü2LIBin1TONGYueyue1
,,,
.DepartmentofStomatologyZhongdaHospitalSoutheastUniversityNanjingChina
(1,,,210048,;
收稿日期修回日期
[]2021-02-02 []2021-11-28
作者简介袁硕男安徽淮南人主治医师医学硕士
[](1990),,,,。E-mail:******@
通信作者李斌
[] E-mail:******@
引文格式袁硕高炳菊李斌等基质金属蛋白酶在舌鳞状细胞癌中的表达及其临床意义东南大学学报医学版
[万方数据],,,.3[J].(),2022,41(2):
245-259.