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蛋白质组学研究中常用的网站和数据库.doc

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蛋白质组学研究中常用的网站和数据库.doc

上传人:1136365664 2017/12/16 文件大小:48 KB

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文档介绍:蛋白质组学研究中常用的网站和数据库
蛋白质, 数据库, 研究
本帖引用网址:http://bbs./thread-35586-1-
一、 (The Universal Protein Resource)   网址:/        /uniprot/  简介:由EBI(欧洲生物信息研究所)、PIR(蛋白信息资源)和SIB(瑞士生物信息研究所)合作建立而成,提供详细的蛋白质序列、功能信息,如蛋白质功能描述、结构域结构、转录后修饰、修饰位点、变异度、二级结构、三级结构等,同时提供其他数据库,包括序列数据库、三维结构数据库、2-D凝聚电泳数据库、蛋白质家族数据库的相应链接。(Protein Information Resource)  网址:/  简介:致力于提供及时的、高质量、最广泛的注释,其下的数据库有iProClass、PIRSF、PIR-PSD、PIR-NREF、UniPort,与90多个生物数据库(蛋白家族、蛋白质功能、蛋白质网络、蛋白质互作、基因组等数据库)存在着交叉应用。(enzyme database)  网址:.org  简介:酶数据库,提供酶的分类、命名法、生化反应、专一性、结构、细胞定位、提取方法、文献、应用与改造及相关疾病的数据。(collection of experimentally verified mammalian plexes)  网址:  简介:哺乳动物蛋白复合物数据库,提供的数据包括蛋白复合物名称、亚基、功能、(cyclic protein database)  网址:  简介:环状蛋白数据库,提供环状蛋白的序列、结构等数据,提供环化蛋白预测服务。-PABP  网址:/  简介:聚阴离子结合蛋白数据库。聚阴离子结合蛋白与聚阴离子的互作在胞内定位、运输、蛋白质折叠等生命过程中起重要作用,此外许多与神经衰退疾病相关的蛋白质均为聚阴离子结合蛋白。该数据库提供已被鉴定的聚阴离子结合蛋白的数据,与NCBI蛋白数据库存在交叉应用。-DB  网址:  简介:G蛋白偶联受体、离子通道数据库。提供这些蛋白的基因、功能、结构、配体、表达图谱、信号转导机制、多样性等数据。  网址:-/ 简介:G蛋白偶联受体-配体数据库,提供G蛋白偶联受体-配体互作数据、配体数据、G蛋白偶联受体数据、同源受体关系网、保守识别区,为新药发现提供了支持。    网址:/  简介:  网址:/interpro/  简介:蛋白质综合数据库,从大量的数据库中整合而成的包括蛋白质结构域、蛋白质家族、功能位点等信息的数据库。