文档介绍：独创性声明
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肺结核分子流行病学研究
摘 要
目的:本研究旨在寻找肺结核的遗传易感位点,探索宿主遗传因素差异对肺结核发病的影响,为肺结核的预防和药物研发提供理论依据。
方法:1、对 1218 名汉族居民进行病例对照研究,其中病例组 600 例,对照组 618 例。进行流行病学调查和生化指标检查。用血液基因组 DNA 提取试剂盒提取 DNA。运用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(restriction fragment length polymorphism–polymerase chain reaction,PCR-RFLP)技术检测 CISH 基因 rs2239751 和 rs622502 的基因多态性,探索 CISH 基因与中国汉族人群肺结核的关联性。
2、验证肺结核 GWAS 中 rs2057178 和 rs4331426 在中国汉族人群中是否与肺结核相关。运用 Pub med 、Embase、中国生物医学文献、中国知网和万方数据库,系统检索 2000 年到 2014 年 3 月 1 日之间发表的研究 rs2057178 多态性或 rs4331426 多态性与肺结核关系的中英文文献,采用 Stata version 软件进行 Meta 分析。
结果:1、病例组平均年龄 ± 岁;对照组平均年龄 ± 岁。差异无统计学意义,P>。病例组痰样本涂片阳性率为 %。胸片 X 线异常率为 %。卡介苗接种率 %。
2、CISH 基因的 rs2239751 和 rs622502 等位基因分布均符合 Hardy-Weinberg(H-W) 遗传平衡定律,表明抽样方法可靠,研究样本的群体代表性较好。
3、rs4331426 和 rs2057178 等位基因分布均符合 Hardy-Weinberg(H-W)遗传平衡定律,表明抽样方法可靠,研究样本的群体代表性较好。
4、CISH 基因 rs2239751 位点多态性与肺结核相关性研究中,rs2239751 位点基因型和等位基因分布在两组间差异有统计学意义,P 值分别为 和 ,并且携带 C 等位基因个体患肺结核的风险是携带 A 等位基因的个体 倍(OR95%CI=-,P=)。
5、CISH 基因 rs622502 位点多态性与肺结核相关性研究中,rs622502 位点基因型和等位基因分布在两组间差异均无统计学意义,P>。
6、验证肺结核 GWAS 中 rs4331426 位点在汉族人群中是否与肺结核相关研究中, rs4331426 基因型频率在病例组和对照组中差异无统计学意义,P>。对基因分型结果按性别,年龄和涂片情况进行分层,仍然显示 rs4331426 基因型频率在病例组和对照组中差异无统计学意义,P>。
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7、验证肺结核 GWAS 中 rs2057178 位点在汉族人群中是否与肺结核相关研究中,
rs2057178 基因型频率在病例组和对照组中差异无统计学意义,P>。对基因分型结果按性别,年龄和涂片情况进行分层,仍然显示 rs2057178 基因型频率在病例组和对照组中差异无统计学意义,P>。
8、rs4331426 的 Meta 分析包括研究对象 16325 人,其中病例组 6176 人,对照组
10149 人。病例组和对照组中 G 等位基因的频率分别为 %和 %。非洲组的异质性检验无统计学意义,因此选用 Peto Mantel-Haenszel method 固定效应模型进行数据合并计算 OR;亚洲组和总体的异质性差异有统计学意义,P<,因此选用 Dersimonian Laird method 随机效应模型进行数据合并计算 OR 值。Meta 分析结果显示 rs4331426 在非洲人群中研究的合