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品种间标准遗传距离.ppt

上传人:likuilian1 2018/2/26 文件大小:2.53 MB

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品种间标准遗传距离.ppt

文档介绍

文档介绍:山西省六个地方羊品种 微卫星位点多态性研究
组员:林树欣林志明
刘江涛刘智宏
陆晓桦罗巧玲
苏淇覃金海
温永恒温馨
刘丽文
报告人:温馨
LOGO
前言
世界自然保护联盟颁布的《2007受威胁物种红色名录》,,比2006年又增加了188种,占了所评估的全部物种的近40%。
山西省是一个养羊大省,绵山羊存栏数量多,地方品种遗传资源十分丰富,但目前一些地方品种正在逐步消失或数量急剧下降,开展资源保护工作显得十分重要。
微卫星
微卫星:是近年来发展起来的一种新型分子遗传标记,已被证实是度量品种遗传多态性、研究品种间遗传关系、估测品种间遗传距离及构建系统发生树的可靠分子遗传标记。
微卫星标记(microsatellite),又称为短串联重复序列(simple tandem repeats,STRs)或简单重复序列(simple sequence repeats),是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列,每个重复单元的长度在1-10bp之间。
微卫星位点可以提供具高分辨率的遗传信息,这一特点使微卫星既适合于个体水平上的研究,又适合于种群水平上的研究。
目的意义
通过用微卫星标记对山西省6 个地方绵、山羊品种DNA 多态性研究, 阐明其遗传结构特性, 为山西省地方绵、山羊品种资源的评价、保护和利用提供理论依据。
检测样品
检测样品采自各品种中心产区,每个品种随机采取品种特征明显的40 只羊的耳组织样品。
微卫星座位及引物序列
微卫星座位、引物序列、 和http: //
引物由北京奥科生物技术有限公司合成
主要试剂
10 x buffer、dNT P、Mg2+ 、T aq酶、Tr is 平衡酚、丙烯酰***等试剂均由太原市来宝生物工程有限公司提供; pBR322 DNA / Msp1 由天根生化科技有限公司提供。
实验步骤
基因组DNA提取
1
PCR扩增
2
PCR 扩增的检测及分离
3
丙烯酰***凝胶染色、拍照及扩增片段
4
数据统计及聚类图绘制
5
电泳检测
及PCR扩增产物
电泳分离
基因杂合度
多态信
息含量
结果与分析
聚类图
标准遗
传距离
基因
流量
优势等位基因
划分
保种区
积极开展细胞工
程、胚胎工程、
基因工程方面研究
实验结论
加强对品种遗传特性研究
总之,山西省6个地方羊品种内遗传多样性信息丰富,是我国宝贵的绵山羊品种资源的重要组成部分,具有重要利用和保护价值。