文档介绍：第五章基因组分析
生物信息学
山西农业大学动物科技学院
基因组分析是现阶段生物信息学的主要任务之一。随着人类基因组及其他生物基因组计划的顺利实施,基因组学进入了一个新的发展时期。
本章将介绍基因组结构分析和作图的基本原理,以及功能基因组学的主要研究方法和分析系统。
基因组分析的主要任务
确定基因在染色体上的位量,提供遗传信息,并探讨基因之间以及基因与经典遗传学、医学(包括基因治疗、跟踪自发突变和X连锁疾病等)诸多方面之间的联系。
基本概念
基因组(genome)是指一个生物体、细胞器或病毒的整套基因。
基因组学(genomics)则以基因组分析为手段,研究基因组的结构组成、时序表达模式(temporal expression pattern)和功能,并提供有关生物物种及其细胞功能的进化信息。
本质上,基因组学属于分子遗传学的分支学科。
方法上,基因组学与一般意义上的基因组分析是一致的。
随着人类基因组及其他生物基因组计划的顺利实施,基因组学开始进人了一个崭新的发展时期,也为人们进行超大规模的基因组分析工作提供了可靠的技术保证。
工作难度
(1) 基因组所含信息量至少比单个基因要高几个数量级。例如,人类基因组含30,000多个基因,基因组大小约3×l09bp,如此巨大的数据量并非常规分析工具所能及;
(2) 尽管人类基因组测序工作己基本完成,但草图序列中存在不少碱基甚至基因组片段的缺失或错误;发现并改正这些错误是一项极为艰巨的工作,而这又是正确解析基因组功能的必备步骤;
工作难度
(3) 现阶段的生物信息学方法在基因组分析方面还是刚刚起步,存在许多不足之处,尚未形成适合于基因组学研究的较为成熟的方法论与技术体系。
基因组研究的巨大密求对生物信息学的发展,既赋予了机会,也提出了挑战。
一、基因组分析原理
1、基因组的结构组成和稳定性☆
2、基因组作图☆
3、基因组计划☆