蛋白质三维结构王镜岩生物化学全.ppt

文档介绍：第五章
蛋白质的三维结构
蛋白质的结构层次
一级结构
二级结构
结构域
三级结构
四级结构
超二级结构
空间结构
化学结构
蛋白质的空间结构
二级结构
超二级结构
结构域
三级结构
四级结构
第一节 稳定蛋白质三维结构的作用力
稳定蛋白质三维结构的作用力主要是一些非共价键或次级键,包括氢键、范德华力、疏水作用和盐键(离子键)。
此外二硫键在稳定某些蛋白质的构象方面也起着重要作用
三维结构中的作用力
包括二硫键、氢键、盐键、疏水作用力、范德华力
氢键-侧链间形成
疏水键
“非极性基团被极性水分子排挤相互聚拢”作用力。
离子键
(盐键)
范德华力(分子间作用力,受彼此距离影响)
键能
肽键
二硫键
离子键
氢键
疏水键
范德华力
90kcal/mol
3kcal/mol
1kcal/mol
1kcal/mol

这四种键能远小于共价键,称次级键
提问:次级键微弱但却是维持蛋白质三维结构中主要的作用力,原因何在?
数量巨大
一、氢键(hydrogen bond)
氢键是稳定蛋白质二级结构的主要作用力。氢键的形成情况:多肽的羰基氧和酰***氢之间形成的氢键,除此之外,氢键还可以在侧链与侧链、侧链与介质水、主链肽基与侧链或主链肽基与水之间形成。
大多数蛋白质所采取的折叠策略是使主链肽基之间形成最大数目的分子内氢键(如α螺旋、β折叠片),与此同时保持大多数能成氢键的侧链处于蛋白质分子的表面将与水相互作用
二、范德华力(van der Waals force)
狭义的范德华力指是非极性分子或基团瞬时偶极间的静电相互作用,所以是一种很弱的作用力。
实际上范德华力包括引力和斥力两种相互作用。非共价键合原子或分子相互挨得太近时,由于电子云重叠,将产生范德华斥力。
虽然就其个别来说范德华力是很弱的,但是相互作用数量大并且具有加和效应,因此就成为一种不可忽视的作用力。