文档介绍:上海交通大学
硕士学位论文
利用AFLP、SRAP标记分析不结球白菜遗传多样性
姓名:刘晓明
申请学位级别:硕士
专业:作物遗传育种
指导教师:陈火英
20080101
上海交通大学硕士学位论文
利用 AFLP、SRAP 标记分析不结球白菜遗传多样性
摘要
白菜类蔬菜包括大白菜和小白菜,原产于我国,是在世界各国
蔬菜品种和蔬菜栽培中独具风格的种类。白菜类蔬菜是我国最早的
栽培植物之一,它们分布广泛,品种资源非常丰富。对其进行遗传
多样性分析,明确白菜类蔬菜之间的分类关系,有助于人们进一步
开发利用其种质资源和更加有效的选择育种材料。
以分子标记技术为主要方法,对不结球白菜种质资源的遗传亲
缘关系进行了分析,在育种上,有利于鉴定有价值的优良亲本的亲
缘关系,为现阶段不结球白菜育种实践中减少杂交组合数目及提高
育种效率提高依据。
本文利用 AFLP 和 SRAP 分子标记方法研究收集的 115 份不结
球白菜材料,分析其遗传多样性,筛选出 10 对多态性较好的 AFLP
引物组合和 28 对多态性较好的 SRAP 引物组合对供试材料进行聚
类分析。同时对所有材料一些形态学性状进行了调查,调查性状包
括叶表面光滑度、叶片边缘、叶片颜色、叶片形状、叶片厚度、叶
柄颜色、叶片绒毛、开花时间、自交亲和性、种皮颜色和株高,对
这 115 份材料进行了聚类分析。最后,115 份材料的形态学聚类结
1
上海交通大学硕士学位论文
果与分子标记聚类结果进行比较,得出分子标记的聚类分析结果有
一定的参考价值。根据形态学的调查结果和通过分子标记聚类结果
有一定的相似性。现将主要结果总结如下:
1. AFLP 分子标记进行 E+3/M+3 引物组合对白菜类蔬菜 DNA
的扩增条带数试验,发现扩增条带数目适中,电泳图谱清晰。
2. 采用银染检测方法,比较了 10 对 AFLP 的 E+3/M+3 引物组
合对白菜类蔬菜 DNA 的扩增总带数和多态性检出率,发现不
同引物的扩增总带数在 15-46 之间,多态检出率在 57%-91%
之间。其中 E32M50 组合是大白菜材料十分高效的引物组合,
共产生 46 条清晰的扩增带,其中有 42 条多态性谱带, 多态
性谱带的百分率为 91%。通过该引物组合,能将 115 份材料
全部区分开来。
3. 采用银染检测方法,比较了 28 对 SRAP 引物组合对白菜类蔬
菜 DNA 的扩增总带数和多态性检出率,发现不同引物的扩增
总带数在 20-29 之间,多态检出率在 %-%之间。
4. 采用 AFLP 和 SRAP 两种分子标记技术对 115 份材料进行了
遗传多样性分析,并根据实验结果所得的 1,0 型数据,利用
DPS 统计分析软件,并采用卡方距离和离差平方法进行聚类
分析,获得聚类图进行比较。
5. 两种分子标记分类结果和形态学性状的分类结果基本一致,
2
上海交通大学硕士学位论文
所有材料均被分为两个大的类别。AFLP 的多态性高于
SRAP,但 SRAP 有操作简单,扩增条带清晰等优点,因此两
种分子标记方法都适合进行不结球白菜遗传多样性的研究。
关键词:不结球白菜,遗传多样性,亲缘关系
3
上海交通大学硕士学位论文
ANALYSIS OF IC DIVERSITY OF
NON-HEADING CHINESE CABBAGE (BRASSICA
CAMPESTRIS SSP. CHINENSIS) BY AFLP AND SRAP
MARKERS
ABTRACT
The vegetable craps of Chinese cabbage originated from China,
prised non-heading Chinese cabbage and heading Chinese
cabbage. It is the unique species with special tastes among all kinds of
vegetable crops in the world and one of the earliest cultivated
vegetables in China. Its germplasm resources are plentiful and have a
wide-range