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96孔微平板中含有3个重复的31种碳源BIOLOG分析代谢指纹技术.ppt

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96孔微平板中含有3个重复的31种碳源BIOLOG分析代谢指纹技术.ppt

上传人:dlmus1 2018/11/10 文件大小:1.52 MB

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96孔微平板中含有3个重复的31种碳源BIOLOG分析代谢指纹技术.ppt

文档介绍

文档介绍:膜磷脂脂肪酸图谱分析(PhospholipidFattyAcidProfile)代谢指纹技术(群落水平生理特征图谱Biolog)munitylevelphysiologicalprofiles(CLPPs)微生物群落结构分析膜磷脂脂肪酸分析脂肪酸微生物i15:0;a15:0;15:0;a16:0;i17:0;a17:0;17:0G+细菌16:17c/+;cyc17:0;18:17c/+;cyc19:0G-细菌16:16c甲烷氧化细菌10Me17:0;10Me18:0放线菌18:26,9;18:36,9,12真菌微生物特异磷脂脂肪酸脂肪酸分子通式:X:YωZ(c/t)X:脂肪酸分子的总碳原子数;Y:烯键的数目;ω:双键的位置(从羧基端起计);后缀c和t分别表示顺式和反式同分异构体a(anto):前异构***支链;cyc:环丙基支链;i(iso):异构***支链;Me:***支链在生物体中的浓度恒定:不随种类、生长条件和生理状态而变化应用细胞中特异化学成分的前提该物质仅存在于活的生物体中,在死亡微生物体或非生物的有机物质中量很小磷脂脂肪酸仅存在于活细胞的细胞膜中,死亡细胞膜磷脂被迅速分解容易从细胞和土壤中提取出来;有测定该物质灵敏、准确的方法PLFAs可从土壤中直接提取出来,并用气相色谱测定其总量及种类特定微生物具有特异性PLFAs,膜磷脂脂肪酸分析反映微生物群体的多样性,可以用来测定微生物量中真菌和细菌比例在生物体中的浓度恒定:不随种类、生长条件和生理状态而变化微生物PLFAs组成随环境及生理状态而有所变化膜磷脂脂肪酸总量与土壤微生物量(SIR法)的相关性(Bååth&Anderson,2003)真菌膜磷脂脂肪酸特异性土壤中麦角甾醇(真菌组成指示物质)和18:2w6,9PLFA含量之间的相关性(Bååth&Anderson,2003)提取测定土壤脂肪酸基本步骤土壤样本脂肪提取***仿:甲醇:缓冲溶液=1:2:(体积比)脂肪组分分离通过硅酸柱将脂肪分为中性脂肪、糖脂和极性的磷脂3个组分根据脂肪酸的饱和度、羧基数目及几何特性等,区分不同种类的磷脂脂肪酸气相色谱分析磷脂脂肪酸量生物多样性指标丰度生态系统中物种总数;SpeciesEvennessDiversityindex Shannon指标 Simpson指标 Berger-Parker指标 Alpha指标膜磷脂脂肪酸分析应用实例-土壤微生物中真菌细菌比例随土壤pH变化真菌细菌生物量系数用18:2w6,9PLFA和13种细菌特有的PLFA分别作为真菌和细菌的指示物(Bååth&Anderson,2003)定量描述微生物群落结构和生物多样性;敏感地反映微生物群落结构变化较为简单、有效微生物的PLFAs组成随环境及生理状态而有所变化大多数微生物细胞膜上占优势的脂肪酸组成很相似,PLFAs分析不能鉴定微生物种类;是较为粗略的反映微生物群落结构和功能多样性的参数,不能指示群落中单个菌种的变化PLFAs方法评价