引物查询办法.doc

文档介绍：引物查询方法
一共有两种查询引物的方法,包括primerbank和primer3,当我们查到引物时,我们需要用Pubmed来验证。详细说明见下文。
Primerbank
用引物银行查询引物时,我们只需要输入引物的名称,种属
网址:/
将search by 修改为keyword
将species修改为您所需要的种属,如mouse
输入您所需查的基因的名字,如atg5
点击submit
点击这里,您将看到引物在编码序列中的位置
您将得到所需查的基因的引物的结果
点击这里绿色的部分,您可以看到这个引物的Qpcr的结果
3
使用这个工具之前您需要在Pubmed中查到您的目的基因的序列,然后黏贴到primer3中,软件便会自动设计引物。
Pumed的使用方法如下:
网址:.gov/pubmed/
输入您的目的基因,如atg7
修改为nucleotide
最后单击search
点击这里选种属
点击fasta选项
筛选符合您需求的,我们是自噬相关的atg7,因此选这个
这就是您所要的序列,复制
Primer3
打开primer3的网址
网址:-/
黏贴如在pubmed中查到的基因序列
修改为None
选中pick left和pick right
点击这个选项
修改为您所需产物的大小范围
这个是软件默认的最好的引物,下面还有其他引物
这就是结果的页面
下拉页面,您将看到软件对您的基因锁设计的全部引物
完成引物