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●技术与方法�《生命的化学�����年��卷�期�
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文章编号:����—��������������������
���微阵列在结核分枝杆菌研究中的应用�
乐�军�’�谢建平�王洪海�
��复旦大学生命科学院,上海������;�上海市肺科医院,上海��������
摘要:高密度���微阵列技术可以通过一次杂交获得大量的基因组信息,广泛用于基因组结构和基因表达谱分�
析。本文简介���微阵列技术在结核分枝杆菌的功能基因组学,致病机理以及耐药机制,诊断等方面的应用。�
关键词:���微阵列;结核分枝杆菌;功能基因组学�
中图分类号:���—��
结核病仍然是威胁人类健康的重要的疾病。耐�表达调控机制是结核分枝杆菌生物学研究面临的主�
多药结核菌株不断增加,结核分枝杆菌与���双重�要障碍。这些信息将有助于阐明结核分枝杆菌的生�
感染,经济全球化产生人口大规模流动,加速结核病�物学功能,揭示宿主与病原体相互作用的动力学,提�
全球蔓延趋势。结核病的基础研究对控制结核病的�供新的抗结核药物靶位。�
蔓延有重要意义。高密度���微阵列技术可以通��.�应用微阵列的比较基因组学�比较基因组�
过一次杂交获得大量的基因组信息,广泛用于基因�学是一种鉴定遗传变异的有效方法,这些遗传变异�
组结构和基因表达谱分析,它克服传统分子生物学�可解释被比较生物的生理、生化和毒力方面的差异。�
方法低通量、操作繁杂、自动化程度低、检测效率低�结核杆菌�����全基因组的破译促使人们采用�
等特点,为认识疾病的发病机制,诊断和药物的筛选����微阵列技术研究基因组的多样性。�����等�
提供前所未有的信息量,具有重要的基础研究价值�应用���微阵列比较结核分枝杆菌毒株�����和�
不同的卡介苗菌株基因组。结核杆菌复合菌群的各�
和临床应用前景。�
菌种���同源性大于��.��% 。利用定制的人工�
�.结核分枝杆菌的功能基因组学研究�
染色体库�������������������������������,����产生�
结核分枝杆菌全基因组序列的测定首次真实地�
的���阵列作为模板,不同结核杆菌全基因组作为�
展示结核杆菌基因组的完全信息。结核分枝杆菌至�
探针进行杂交试验。发现除���一���外,牛分枝�
少有����个可读框�������������������,����,具有�
杆菌��.���/��和卡介苗菌株的染色体内有�个缺�
潜在编码蛋白质的功能。这些蛋白质中大约三分之�
失区域����������������,���。结核杆菌复合菌群�
一的功能可准确预测;另外的三分之一的功能将其�
各菌种间的缺失区域的分布与宿主特异性和毒力基�
归类于某个功能种类或有与其它细菌有明显同源�
因相对应�。应用微阵列技术,检测卡介苗不同子�
体;基因组中剩余三分之一的基因编码蛋白我们一�
代菌株基因组的多样性,共发现��个��,某些���
无所知或知之甚少⋯。确定这些蛋白质功能,以及�
具菌株特异性。全部卡介苗菌株均缺失�个