文档介绍：中国农业科学
2012,45(3):414-425
Scientia Agricultura Sinica
doi: .0578-
中国野生大豆群体特征和地理分化的遗传分析
范
虎,赵团结,丁艳来,邢光南,盖钧镒
(南京农业大学大豆研究所/农业部大豆生物学与遗传育种重点实验室/国家大豆改良中心/作物遗传与种质创新国家重点实验室,南京 210095)
摘要:【目的】从分子标记等位变异水平上探讨中衡特点和地理生态
分化的遗传机制,并以重要生态性状全生育期为代表解析性状地理分化的遗传基础。【方法】从全国 24 个省区不
同地理生态型的野生大豆材料中抽选 174 份组成代表性样本,选用 204 个 SSR 标记,利用 TASSEL 及 STRUCTURE
软件进行群体连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)和群体遗传结构分析。在此基础上对群体的地理分化、
亚群体特异性及全生育期位点等位变异的地理分化进行遗传分析。结果】中国野生大豆群体蕴含丰富的遗传变异,
20 条连锁群中,I 和 C2 连锁群有相对较多的位点平均等位变异和遗传分化。不论是共线性组合,还是非共线性组
合,都有一定程度的 LD 存在,说明历史上发生过连锁群间的大量重组;野生群体 D ′平均值为 ,高值多,比
栽培大豆高,说明野生群体发生过更多的重组,保留下较高的 LD。采用 H-W 平衡模型将野生群体聚成 4 类,模型
聚类亚群划分与地理生态分类相关、有交叉,推测各地理亚群体发生过材料的迁移。各地理亚群经长期自然选择,
各位点等位基因的频率发生变化,还有新生的与绝灭的,因此,各地理亚群间产生明显的等位基因分化。与地理
生态性状全生育期关联的有 15 个位点 160 个等位变异,其中,亚群特有等位变异共 58 个,来自 14 个位点,同一
位点可以在多个亚群体产生不同的特有等位变异,其效应从南至北逐渐下降,这说明生态区间不仅有强烈的遗传
分化,而且是有规律的遗传分化。【结论】中国野生大豆群体遗传多样性高,共线、非共线位点间连锁不平衡程度
高,4 个生态亚群体间位点高度遗传分化,产生大量地区特有等位变异,全生育期还表现由南向北降效的规律性
遗传分化。
关键词:野生大豆(Glycine soja Sieb. et .);SSR;连锁不平衡(LD);群体结构;地理分化;全生
育期遗传分化
ic Analysis of the Characteristics and Geographic
Differentiation of Chinese Wild Soybean Population
FAN Hu, ZHAO Tuan-jie, DING Yan-lai, XING Guang-nan, GAI Jun-yi
(Soybean Research Institute of Nanjing Agricultural University/MOA Key Laboratory for Soybean Biology, ics and
Breeding/National Center for Soybean Improvement/National Key Laboratory for Crop ics and Germplasm Enhancement,
Nanjing 210095)
Abstract: 【Objective】 The objective of the present study was to explore the ic characteristics, linkage disequilibrium
(LD) and ic mechanism of geographic differentiation of the Chinese wild soybean population, and based on it, the geographic
differentiation mechanism of days to maturity, the key geographic-ecological trait, is to be revealed. 【Method】 A posed
of 174 accessions of wild soybean (Glycine soja Sieb. et .) from all growing areas (24 provinces) in China was established as the
represen