文档介绍：芁凡纳滨对虾论文:凡纳滨对虾AMY、CTSL基因SNPs及其与生长性状地关联分析膂罿【中文摘要】本研究以海南南疆生物技术有限公司对虾繁育中心凡纳滨对虾繁育群体地379尾个体为研究对象,采用PCR-RFLP/PCR-SSCP标记技术结合DNA测序方法对研究凡纳滨对虾群体地AMY基因和CTSL基因地遗传多态性进行了分析,同时与生长性状进行相关性分析,以检测对凡纳滨对虾生长发育具有影响作用地分子遗传标记,-A9进行检测,分别包含了外显子2-9区域,在A2、A3、A7、A8和A9这5个基因座中未发现多态性,在A4、A5和A6基因座上发现了多态性,PCR-SSCP/PCR-、A5和A6基因座不同带型地PCR扩增产物进行测序,共发现4个SNP位点,分别为:第4外显子109bp处T→C地突变、第4内含子46bp处T→C地突变、第5外显子123bp处C→T地突变和第6外显子81bp处C→T地突变,其中A4基因座地2处突变表现为连锁突变,4处突变均未引起氨基酸地改变,,结果A4、A5和A6基因座有效等位基因Ne、杂合度He及多态信息含量PIC分别为:/、//,3个多态位点在该凡纳滨对虾群体上均处于中度多态,说明AMY基因地A4、A5和A6这3个基因座多态性比较丰富,,结果发现:A4基因座不同基因型对其生长性状具有显著影响,在体长、头胸甲宽、第一腹节长及尾节长4个指标上,基因型显著高于杂合基因型CT(P<);、TT和CT3种基因型之间差异均达到了显著水平(P<).A5基因座:、CT和TT3种基因型之间差异均达到了显著水平(P<);与CT基因型之间差异不显著,但与TT基因型之间地差异达到了显著水平(P<).A6基因座:在体重、头胸甲长和头胸甲宽3个指标上,AA基因型与AB基因型之间差异显著(P<);在体长、第一腹节长和尾节长3个指标上,AA、BB基因型与AB基因型之间差异达到了显著水平(P<).-C6进行检测,包含了外显子2-6及部分内含子区域,在C6基因座中发现有多态性,在其它基因座中未发现多态性,PCR-SSCP检测结果出现了3种带型,、,发现在CTSL基因第6外显子地92bp处存在1个C→T地碱基突变,该处碱基地改变未引起氨基酸地变化,,结果C6基因座有效等位基因Ne、杂合度He及多态信息含量PIC分别为:、,,C6基因座不