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NTI使用手册中文版.doc

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NTI使用手册中文版.doc

上传人:88jmni97 2019/4/16 文件大小:164 KB

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文档介绍

文档介绍:第一章安装和执行程序第一章安装和执行程序 VectorNTI目前为网络版本,需要连到主机确认用户权力后才能运作。厂商并没有针对授权时间进行限制,因此只要设定好LicenseServer的相关设定即可使用,不需要额外进行申请。但用户IP位置必须位于海洋大学校内,方可与授权服务器联机。请下载下面这个档案进行安装,变更为自服务器取得授权的方式:→程序集→Invitrogen→VectorNTIAdvance10→LicenseManager()。(),点选下面的Dynamic按钮,上面四个字段请填上使用者的姓名,系所单位,电话和电子邮件位置,最下面一栏URLofDLS请入以下字符串::8080/。DLSServerrequiresauthentication目前不需要勾选。.Settings()里面建议选取DirectConnection,这样当IE设定Proxy之后,才不会导致VectorNTI因为IP不在校内而不能联机。 ,程序会自动联机测试,如果在右边的联机结果显示ConnectionOK(),就表示设定成功;如果显示Connectionerror,则表示联机不成功,如果有开启防火墙/防病毒软件,请关闭或调整设定后再试一次。,成功右下角会显示ConnectOK,在Dynamiclicense的页面记得按下Apply,最后在Applications()把所有项目的Demomode改成Dynamiclicense。,将所有的Demomode改为Dynamiclicense ,如果发生联机问题请与本中心的人员联络。联机设定完成后就可以开始执行程序来操作了,首先NTI的文件夹有许多项目可供选择:其中一个为主程序(VectorNTI),而其他的功能项目是附加在主程序底下,可以各别开启操作,也可以在主程序下面执行()。://,点选OK。这样DNAmolecules,proteins,enzymes,oligos,andgelmarkers将组成NTI的数据库,并出现下列三个窗口()。,右边为图谱窗口,下方为序列窗口图谱窗口文字窗口序列窗口这三个窗口为文字窗口、图谱窗口和序列窗口。文字窗口会将分析结果,作简单的文字叙述,并且可以自动做注记;图谱窗口会将序列以一个卡通图形进行说明,同时具有绘图的功能;序列窗口会将分析结果,标定在序列上面,以序列呈现出来。接下来就是将序列加载程序中,我们可以将实验或是搜寻所获得的序列数据放进程序,本文将以一个针对斑马鱼基因筛选实验所得到的序列作为范例。加载序列最直接的方式是从程序的左上角点选File→Open将序列档案开启,但是注意档案必须为GenBank/GenPept,EMBL/SWISS-PROT或FASTA、ASCII等格式,要在符合格式的情况下才能顺利开启序列。另一种方式是用剪贴的方式将序列贴入程序中,将在第二章介绍。,接下来必须要先了解NTI的数据是如何储存和读取,并且建立自己的序列数据库。NTI的程序中会有一个内建好的数据库,在同时把存盘的路径预先设定在数据库的位置之中。我们自身主机的数据库叫做LocalDatabase,同时NTI提供了数据库分享的功能,可以透过网络和其他主机交换或分享序列数据。如何建立自己的数据库?首先在主程序下点选数据库,图示():