文档介绍：黔边边苏州大学学位论文独创性声明呈旦丛:亟:生本人郑重声明:所提交的学位论文是本人在导师的指导下,独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外,本论文不含其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果,也不含为获得苏州大学或其它教育机构的学位证书而使用过的材料。对本文的研究作出重要贡献的个人和集体,均已在文中以明确方式标明。本人承担本声明的法律责任。论文作者签名:期:�
皿日隘边边日在——年一月解密后适用本规定。苏州大学学位论文使用授权声明呈殳�:五��期:丑丝:���本人完全了解苏州大学关于收集、保存和使用学位论文的规定,即:学位论文著作权归属苏州大学。本学位论文电子文档的内容和纸质论文的内容相一致。苏州大学有权向国家图书馆、中国社科院文献信息情报中心、中国科学技术信息研究所��蚍绞�莸缱映霭嫔�、中国学术期刊�馀贪�电子杂志社送交本学位论文的复印件和电子文档,允许论文被查阅和借阅,可以采用影印、缩印或其他复制手段保存和汇编学位论文,可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索。涉密论文口本学位论文属论文作者签名:导师签名:非涉密论文口期:·
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。预测蛋白质的核心拓扑模式,不仅有助于解构蛋白质三维结构,而且有助于设计和改造药物结构。本文面向蛋白质结构的预测,研究蛋白质结构拓扑建模技术,一是基于折叠模式的蛋白质拓扑建模及其应用,二是一类特定蛋白质的拓扑建模及其应用。折叠模式是蛋白质结构拓扑的一种分类表达。本文利用一个基于��结构库折叠模式预测器输出的待测蛋白质的折叠模式,将��中相同折叠模式的蛋白质结构作为生成片段库的重要基础,生成了高质量的片段库。将这种片段库应用于蛋蛋白质中一类特殊的�鞍着剂J芴����哂刑囟ǖ耐仄耍珿��赜�的�鰊跨膜螺旋决定了它的主要拓扑特征。本文基于一种预测跨膜螺旋二维结构的方法,抽取出跨膜螺旋空间距离约束,同时又总结出跨膜螺旋与膜的朝向以及在膜中的倾斜角度两种约束,以此为基础开发了一个应用了三种拓扑约束的跨膜螺旋堆积方法。将开发的方法应用于最新的测试中,结果表明,本文提出的方法对跨膜螺通过计算机方法利用蛋白质折叠模式的拓扑,为组装蛋白质片段提供了高质量关键词:结构拓扑,建模,折叠模式,跨膜螺旋,约束作者:陈沙沙白质结构预测中的一些难题,表明采用本文方法的片段库很好地提高了结构预测的精度。旋结构的预测准确度有了一定的提高。的搜索空间;而对��拓扑进行建模及其相关的螺旋堆积方法,对��对接等许多后续应用提供了有用的工具。指导教师:吕强摘要
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录目引言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.课题背景⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯课题内容⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯研究意义⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯本文的组织结构⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..蛋白质结构拓扑建模技术概述⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯蛋白质结构相关知识描述⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..基于折叠模式的蛋白质拓扑描述⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.��结构功能介绍⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯��的亲脂性⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.��.�缒ぢ菪���介绍⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯蛋白质结构面向计算的描述⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯蛋白质结构⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯蛋白质结构在计算机中的表达⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯蛋白质结构拓扑的建模现状⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯基于折叠模式的建模方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.跨膜螺旋结构拓扑建模方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..常用的蛋白质相关数据库⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..�����������������������⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..���⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.����������������������本章小结⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯基于折叠模式识别的片段库生成及其应用⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.�’问题描述⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯�第三章第一章第二章����.���,����琂,�琂,上�,�琹,�琹,工
构建片段库的重要性⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.���基于折叠模式的片段库构建方法的设计⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯·��