文档介绍：中国农业科学 2012,45(11):2107-2138
Scientia Agricultura Sinica doi: .0578-
基于 40 个核心 SSR 标记揭示的 820 份中国玉米
重要自交系的遗传多样性与群体结构
刘志斋 1,4,吴迅 1,刘海利 1,李永祥 1,李清超 1,王凤格 2,石云素 1,宋燕春 1,宋伟彬 3,
赵久然 2,赖锦盛 3,黎裕 1,王天宇 1
(1 中国农业科学院作物科学研究所,北京 100081;2 北京市农林科学院玉米研究中心,北京 100097;3 中国农业大学国家玉米改良中心,北京 100094;
4 西南大学玉米研究所,重庆 400715)
摘要:【目的】选择有代表性的材料进行遗传多样性与群体结构的解析是进行等位基因发掘、复杂性状关联
分析、研究,及作物育种实践的重要基础。【方法】利用覆盖玉米全基因组的 40 个核心 SSR 标记,采用基于测序
的基因型鉴定技术对 820 份代表中国玉米育种资源种质基础的自交系进行全基因组扫描,通过 PowerMarker
与 Structure 等软件揭示其基因多样性与群体结构。【结果】在 820 份自交系中,40 个 SSR 标记所检测到
的等位变异为 10—72 个,平均 个/位点;基因多样性为 —,平均 ;PIC 为 —,
平均 。聚类分析表明,K=5 时,△K 值最大,即这些自交系可以划分成 5 个类群,依次为兰卡斯特、旅大红
骨、塘四平头、瑞德与 P 群,各类群内平均等位变异与遗传多样性分别为 个/位点与 、22 个/位点与
、 个/位点与 、 个/位点与 以及 个/位点与 。【结论】中国玉米自交
系在育种实践中形成了相对独立的优势类群,蕴含了比较丰富的遗传变异,显示出了较高水平的基因多样性。不
同类群之间的遗传多样性水平存在一定的差异,在划分的 5 个类群中,兰卡斯特与旅大红骨类群的遗传变异相对
较丰富,基因多样性相对较高,其次为瑞德与 P 群,塘四平头相对较低。
关键词: 玉米;自交系;遗传多样性;群体结构
ic Diversity and Population Structure of Important Chinese
Maize Inbred Lines Revealed by 40 Core Simple Sequence
Repeats (SSRs)
LIU Zhi-zhai1,4, WU Xun1, LIU Hai-li1, LI Yong-xiang1, LI Qing-chao1, WANG Feng-ge2, SHI Yun-su1,
SONG Yan-chun1, SONG Wei-bin3, ZHAO Jiu-ran2, LAI Jin-sheng3, LI Yu1, WANG Tian-yu1
(1Institute of Crop Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081; 2Maize Research Center, Beijing Academy of
Agriculture and Forestry Sciences, Beijing 100097; 3National Maize Improvement Center of China, China Agricultural University,
Beijing 100094; 4Maize Research Institute, Southwest University, Chongqing 400715)
Abstract: 【Objective】ic assessment, . gene diversity and population structure, of representative accessions is of great
importance in the utilization of these germplasm, allele mining, and analysis of association mapping. 【Method】Forty core SSRs
developed for the fing