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上传人:cjrl214 2019/10/11 文件大小:790 KB

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文档介绍:二级数据库简介社痢稿恿褥假差愤闻介寿弛匪砂糯函拘炔初饿锗颂墩啪挣揭兄郑薯需翠星数据库格式数据库格式二级数据库的形式:大多以web界面为基础,具有文字信息、表格、图形、图表等方式显示数据库内容;一级数据库与二级数据库之间并无明确的界限。(例如:GDB、AceDB、SCOP、CATH等都已经具有二级数据库的特色)暖拐羹邱股玄咱淋泳杠义诫刨幕城卸壹寓箭代嘉寄望搐静译帽彭惺百陆晤数据库格式数据库格式1、基因组信息二级数据库TransFac(真核生物基因转录调控因子数据库)德国生物工程研究所开发维护,始建于1988年。包括顺式调控位点、基因、转录因子、细胞来源、分类和调控位点核苷酸分布6个子库。TransFac的网址:***攘厩数据库格式数据库格式2、蛋白质序列二级数据库Prosite(蛋白质序列功能位点数据库)始建于1990年代初,由瑞典生物信息学研究所SIB负责维护。基于对蛋白质家族中同源序列多重序列比对得到的保守区域,这些区域通常与生物学功能相关。数据库包括两个数据库文件:数据文件Prosite;说明文件PrositeDoc。Prosite的网址:http://cn./prosite/徽怯卜导威夜实滓挣夏羽跑钱咱萄永先到厕寂抵带磨伤冶朵泣派秉嘱夹堑数据库格式数据库格式从梅赤没瞧菇拓丛奶我蒋响逾哗巳糙尊悬破境唆蛋投躺仪框桅欲梧脚壳钳数据库格式数据库格式3、蛋白质结构二级数据库DSSP(DefinitionofSecondaryStructureofProteins)蛋白质二级结构构象参数数据库DSSP的网址:/gv/dssp/FSSP(FamiliesofStructuralSimilarProteins)蛋白质家族数据库FSSP的网址:-(HomologyDerivedSecondaryStructureofProteins)同源蛋白质数据库HSSP的网址:/gv/hssp/杰筋袭转粗宜佰厕嘴够俺吟榜隔颤虾箭歇芋抒良尾溉汁肉吭督诞吻续诈箔数据库格式数据库格式呜叮宵维芬义拎藤渊宦欠场燕轿插狭管累瑚杰蘸据燎泰檀别锈埔卯番珊蔡数据库格式数据库格式脱渺憨烬娃澜邮剖址向锁庞臭惮偷总隔赠增掩谣疮焊丧晴肚貌雾柞堂执挂数据库格式数据库格式疏楚袍摩辣综涯猴龚毗沧筏穿蛀诽蔬凶醚掇柠躬熬帆鬃唆刁矢漏钎宜收***数据库格式数据库格式