文档介绍：Summary该总结文件包含了所有在Maxquant运行当中所有原始数据文件的信息名称分隔描述说明Rawfile原始数据的处理加工Enzyme用于消化蛋白样品的蛋白水解酶Enzymemode同上Enzymefirstsearch用于firstsearch的蛋白水解酶Enzymemodefirstsearch同上Useenzymefirstsearch当有不同的蛋白酶用于设置firstsearch时,标记为“+”Variablemodifications(翻译为可变修饰)用于多肽鉴定当中的可变修饰Multimodifications多重修饰用于鉴定多肽当中Variablemodificationsfirstsearch在firstsearch当中的可变修饰Usevariablemodificationsfirstsearch当有不同的可变修饰用于设置firstsearch时,标记为“+”Requantify用在鉴定当中的标签的数量(例如同位素标签,这里应该特质同位素标签),其中,0为轻标,1为中标,2为重标LC-MSruntypeLC-MS运行的模式,当用于数据依赖性的传统的鸟枪法来做蛋白质组学时,设置为“standard”(标准模式)Time-dependentrecalibration时间依赖性的再校准:当出现该校准时,数据框内标记为“+”,时间依赖性的校准用于提高数据的质量MS在原始数据当中的MS1记录的数据量MS/MS在原始数据当中的MS2记录的数据量MS3在原始数据当中的MS3记录的数据量MS/MSsubmitted用于软件分析的串联的MS的数量这里所说的串联质谱可以认为是二级质朴MS/MSsubmitted(SIL)用于软件分析的串联的MS的数量,这里检测的是作为标记簇(重标组,labelingcluster)的母离子被检测。MS/MSsubmitted(ISO)用于软件分析的串联的MS的数量,这里检测的是作为同位素模式的母离子被检测。MS/MSsubmitted(PEAK)用于软件分析的串联的MS的数量,这里检测的是作为单个峰(singlepeak,这里的单个峰的意思应该是没有同位素峰)的母离子被检测。MS/MSidentified鉴定到的串联质谱数的总数量MS/MSidentified(SIL)鉴定到的串联质谱数的总数量,这里检测的是作为标记簇(重标组,labelingcluster)的母离子被检测。MS/MSidentified(ISO)鉴定到的串联质谱数的总数量,这里检测的是作为同位素模式的母离子被检测。MS/MSidentified(PEAK)鉴定到的串联质谱数的总数量,这里检测的是作为单个峰(singlepeak,这里的单个峰的意思应该是没有同位素峰)的母离子被检测。MS/MSidentified[%]被鉴定到的串联质谱的比例MS/MSidentified(SIL)[%]被鉴定到的串联质谱的比例,这里检测的是作为标记簇(重标组,labelingcluster)的母离子被检测。MS/MSidentified(ISO)[%]被鉴定到的串联质谱的比例,这里检测的是作为同位素模式的母离子被检测。MS/MSiden