文档介绍：蛋白质的高级结构二级结构三级结构四级结构高级结构的测定结构与功能的关系Many different forces work together in a delicate balance to determine the overall three-dimensional structure of a protein一、维系蛋白质高级结构的力?氢键Hydrogenbonds?疏水作用Hydrophobic interactions?盐键Electrostatic bonds?范德华力Van der Waals forces ?二硫键Disulfide bonds氢键?无处不在?稳定蛋白质二级结构最主要的作用力?羰基氧与酰胺氢之间、侧链之间、侧链与水之间、主链与侧链之间、主链与水之间?蛋白质折叠策略是使主链肽基之间形成最大数目的分子内氢键,同时保持大多数成氢键的侧链处于蛋白质的表面从而与水相互作用疏水作用?水介质中球状蛋白质的折叠注视倾向于把疏水残基埋藏在分子的内部,称疏水作用。?疏水作用使水与疏水残基之间发生的作用力最小?蛋白质折叠一个首要的推动力?非极性溶剂和去污剂可破坏疏水作用,所以可作为蛋白质的变性剂?盐酸胍和尿素既破坏疏水作用,又破坏氢键,所以是强烈的变性剂。盐键/离子键?正电荷和负电荷之间的静电相互作用?酸性氨基酸与碱性氨基酸之间形成?较少形成范德华力?主要的是分散效应起作用?非极性基团间发生?包括引力和斥力?当两个非键合原子处于一定距离时引力最大,称范德华距离?单个范德华力很微弱,但是数量大且具有加和效应和位相效应。不可忽视二硫键对蛋白质折叠为正确的高级结构起到重要的作用二、蛋白质的二级结构secondary structure,207页?1、定义:是指肽链的主链在空间的排列,或规则的几何走向、旋转及折叠。它只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键。主要有?-螺旋、?-折叠、?-转角。?2、主要类型:α—螺旋(α—helix) β—折叠(β—sheet)β—转角(β—turn)无规卷曲(random coil)?肽链内形成氢键,氢键的取向几乎与轴平行,第一个氨基酸残基的酰胺基团的-CO基与第四个氨基酸残基酰胺基团的-NH基形成氢键。