文档介绍:
柑橘全爪螨几丁质脱乙酰酶基因 PcCDA 的
克隆与表达分析#
廖重宇,钟锐,丁天波,豆威,王进军**
5
10
15
20
25
30
35
40
(西南大学植物保护学院,重庆 400716)
摘要:昆虫几丁质脱乙酰酶作为重要几丁质代谢酶类之一,参与生物体生长发育期间的蜕皮
及新表皮的形成过程,同时,还能作为一种屏障保护生物体免受各种类型的伤害和传染性病
害。本文基于柑橘全爪螨转录组数据,利用 RT-PCR 以及 RACE 技术扩增获得全爪螨几丁
质脱乙酰酶基因 cDNA 全长一条。该 cDNA 序列全长 1937bp,包含一个 1599bp 的开放阅读
框,编码 532 氨基酸的多肽,分子量约为 ,等电点 。系统发育分析发现 PcCDA
为 GROUPⅠ,含有 ChBD、LDLa、CDA 等 3 个结构域,其推导氨基酸序列与二斑叶螨 CDA
一致性最高,达 %。qRT-PCR 分析结果表明,PcCDA 在卵期的相对表达量显著高于其
它 3 个发育阶段(幼螨、若螨、成螨)。研究结果明确了 PcCDA 序列的生物学信息,同时
初步揭示了 PcCDA 在柑橘全爪螨生长发育过程中的表达模式。。
关键词:农业昆虫与害虫防治;柑橘全爪螨;几丁质脱乙酰酶;cDNA 克隆;系统发育分析;
定量 PCR
中图分类号:
<Cloning and expression analysis of chitin deacetylase of
Panonychus citri>
LIAO Chongyu, ZHONG Rui, DING Tianbo, DOU Wei, WANG Jinjun
(College of Plant Protection, Southwest University, Chongqing 400716)
Abstract: Chitin deacetylase (CDA) plays an important role in insect chitin metabolism. CDA not
only participate in the maturation of cuticle anisms, but also anisms from various
physical damage and pathogens infections. In this study, on the base of transcriptome datasets, the
cDNA sequence of PcCDA was cloned by RT-PCR and rapid amplification of cDNA ends (RACE).
The full length of PcCDA was 1937bp, which contained an open reading frame (ORF) of 1599bp and
encoded a polypeptide of 532 aa residues with a predicted molecular weight of about . PcCDA
contained a