HyperChem基本操作 画二维草图.doc

文档介绍：HyperChem基本操作 ,打开ElementTable对话框。,关闭ExplicitHydrogens。如果关闭ExplicitHydrogens,在画分子的时候,不自动添加氢。,接着关闭对话框。碳设置为缺省元素。。。,选择Symbol。靠近Symbol的单选按钮会被填充。。Labels对话框消失,所有的原子将标注元素符号。删除原子:。,或者想要删除的价键中部。原子和价键就会消失。删除多个原子或价键:。。。。puted没有限制。由模型决定键长。Other:输入一个大于0至1000埃的正数。。原子类型(AtomTypes)在分子动力学计算中,分子中每一个原子都有原子类型。原子类型代表具有相似化学环境的一系列同类元素原子。环境参数包括杂化及其它因素。例如,AMBER原子类型C代表一个sp2羰基碳,CT代表四面体碳,CH代表一个包括一个氢原子的sp3碳。分子动力学计算用相同的方法处理同一类型的所有原子。每一种力场用于一系列不同类型的原子。原子类型一般需要分子动力学计算。但不是半经验计算。每一种原子类型都有一个不同于其他力场的名称。力场需要原子类型来获得计算参数。MM+力场可以处理缺省的原子类型(用未知类型**表示)。当在画一个新的分子的时候,HyperChem给每个原子一个类型名称**,表示没有指定原子类型。当在Build菜单选择ModelBuild或者CalculateTypes,或者改变力场(使用Setup菜单的MolecularMechanics),HyperChem使用MolecularMechanicsForceField对话框中选择的力场指定恰当的原子类型。指定类型后,保留的**意味