甘蔗B12D基因cDNA全长克隆与表达分析.doc

文档介绍：
甘蔗 B12D 基因 cDNA 全长克隆与表达分析
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张玉叶,黄宁,肖新换,黄珑,苏炜华,许莉萍,阙友雄**
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(福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/国家甘蔗产业技术研发中
心,福建福州 350002)
摘要:对甘蔗(harum officinarum)茎全长 cDNA 文库进行大规模测序,获得了 B12D
基因的全长 cDNA 序列,命名为 ScB12D(GenBank:KF714497)。生物信息学分析表明,该
基因全长 771bp,编码 87 氨基酸(ORF,104~367bp)。该基因编码的蛋白无信号肽,为亲
水性非分泌型蛋白;有一个 B12D 家族保守结构域,二级结构为无规则卷曲;基因定位于质
膜,参与能量代谢。荧光定量分析结果表明,在非生物胁迫时,该基因的表达受氯化钠胁迫
后表达量最高,在脱落酸胁迫下表达量次之;在生物胁迫黑穗病胁迫下,该基因的表达量在
不同时间段下呈下调趋势。表明该基因的表达可能与甘蔗响应生物和非生物胁迫的机制有
关。研究结果为甘蔗 B12D 基因的克隆、功能验证及其在甘蔗基因工程中的应用打下了基础。
关键词:甘蔗;B12D 基因;生物信息学;荧光定量 PCR
中图分类号:
Cloning and Expression Analysis of B12D Gene in
Sugarcane
ZHANG Yuye, HUANG Ning, XIAO Xinhuan, HUANG Long, SU Weihua, XU
Lipin, QUE Youxiong
(Key Laboratory of Sugarcane Biology and ic Breeding , Ministry of Agriculture基Fujian
Agriculture and Forestry University/Sugarcane Research & Development Center, China
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Abstract:
Agriculture Research System, Fuzhou Fujian 350002, China)
A full length cDNA sequence of sugarcane gene was obtained from
sugarcane(harum officinarum ) stem full length cDNA library through large-scale sequencing
and validated by the corresponding bioinformatics analysis, termed ScB12D (Genbank :
KF714497). The full length of ScB12D gene was 771 bp, with a 264 bp open reading frame (ORF),
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encoded 87 amino acids residues. The ScB12D of sugarcane was a basic protein, which has a
cons