文档介绍：中国科学院计算技术研究所
硕士学位论文
面向体系结构的串匹配算法优化研究
姓名:戴正华
申请学位级别:硕士
专业:计算机系统结构
指导教师:冯圣中
20060601
算法为代表,计算复杂度为。妒弧ɡ嗍且訸算法为代表,计算复摘要串匹配算法广泛应用于生物信息学、信息检索等领域。随着基因数据和网络数据的爆炸式增长,对串匹配算法的性能也提出更高的要求。本文从计算机体系结构的角度出发,立足于开发串匹配算法的数掘并行性和提高算法的阅堋1疚牡闹饕9ぷ靼ǎ赟噶罴亩婊惴ㄊ莶⑿行钥7⒂⑿行浴;谇扒计算思想,优化设计了算法,充分挖掘了算法的数据并行性,并基于指令集实现,数倍提高了该算法性能。通过设计辅助矩阵,有效组织数据,优化设计了惴ǎ杂诮洗蟮氖莨婺#竦昧私咏砺壑档募铀俦取谧楹献址母咝阅躶惴ㄑ芯算法广泛应用于内容过滤领域。基本的算法以类型的字符集合作为字符集,因而状态转换单位为1疚耐ü楹螻的状态,建立∑.。上的状态转换单位提高为驼灾档土俗远刺;淮问岣吡思扑阈剩嫦蛭徊⑿械牡湍诖婵O咝阅芄丶时泶锸狡ヅ渌惴ㄑ芯关键词表达式匹配算法是一类重要的串匹配算法。本文面向位并行,利用和分治等优化方法设计了新的关键词表达式匹配算法,可提高计算效率、降低内存开锖。关键词:串匹配算法;凰惴ㄓ呕晃徊⑿』
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第一章引言作为一类基本算法,串匹配算法广泛应用