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广东畜牧兽医科技年鲞箜塑试验研究· ·
株蛋白编码序列的序列测定和特性分析
秦宏阳,曹宗喜·,汤国凯,张得玉,于淼,孔维立,张桂红
.华南农业大学兽医学院,广东广州;.江门市新会区畜牧局,广东江门
摘要:针对基因组设计了对特异性引物,利用—的方法,对在南方地区分离的
株基因进行了基因扩增,克隆到载体后测序,获得了株基因全长
的核苷酸序列。利用生物信息学软件对株基因序列进行了遗传进化分析,结果显示
、、、株与美洲型参考株的核苷酸序列同源性分别为.%、.%、.%和
.%。利用系统进化树分析表明、、、株均属于美洲型。进一步采用序列分析软件对病毒
结构蛋白推导糖基化位点比较,结果表明不同毒株糖基化位点在基序和位置上均有所不同,这可能与
毒株的毒力、免疫原性的差异相关, 这些为更好地了解的分子流行病学特征和抗原变异规律提供依
据, 同时为研制基因工程疫苗奠定了基础。
关键词:猪繁殖与呼吸综合征:蛋白;序列测定;特性分析
中图分类号:. 文献标识码: 文章编号: ———
猪繁殖与呼吸综合征的主要结构蛋白和主要免疫保护性蛋白之一,有
,是由猪繁殖与许多独特的免疫学和生物学特性,在病毒的致病
呼吸综合征病毒和机体的抗病毒免疫中发挥着重要的作用。
, 引起猪的本研究对从南方部分地区疑似高热病病例中
一种高度传染性疾病。该病自年首次发现以分离到的株基因序列进行分析,参
来,己遍及世界各个养猪国家。它所引发的母猪考国内外己发表的基因序列构建基因系统发育树,
流产和仔猪的呼吸障碍给养猪业造成了灾难性的以阐明所分离株的基因型和遗传进化地位;同时,对
打击。特别是年以来,变异株的出现这株分离毒株的蛋白抗原性、亲水
给我国养猪业的发展产生了巨大的影响瞳,。性、表面抗原位点和糖基化位点进行分析,并与国内
为不分节段、有囊膜的单股正链外毒株蛋白的抗原性进行比较分析,为更好地
病毒。其基因组长度约为,包含有个了解的分子流行病学特征和抗原变异规律
开放阅读框,。从提供依据,同时为研制基因工程疫苗奠定了基础。
到依次为/、/和一, 材料和方法
每个—和相邻的部分重叠。. 材料、、和四株分
在其端和端分别有一非编码区。在非编别从南方地区几个疑似猪无名高热症状的猪场病
码区前有一个“帽子”结构,非编码区后有多聚料中采集得到,阳性对照—株由
腺苷酸尾巴。和组成了% 华南农业大学兽医学院禽病教研室分离保存。
的病毒基因组,编码病毒的复制酶、聚合酶。. 引物设计参考上注册的基
/和一编码病毒结构蛋白,其中因组序列,,设计覆
和一编码病毒的糖基化蛋白, 盖整个基因的一对特异性引物:一
编码膜基质蛋白蛋白,编码核衣壳一,: 一
蛋白蛋白,。根据抗原性的不同,分离,其预计扩增长度为。各引物
株可分为欧洲型原型毒株为和北美洲型原均由上海英骏生物技术有限公司合成。
型毒株为。其中囊膜蛋白是. 四株病毒基因的扩增按常规方法
收稿日期:—一
基金项目:国家高技术研究发展计划计划项目;
国家生猪现代农业产业技术体系;广东省农业类计划项目—
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株蛋白编码序列的序列测定和特性分析一秦宏阳,等试验研究· ·
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