文档介绍：学校编码 10390 分类号 Q347
学号 2008217004 密级内部 2 年
硕士学位论文
文昌鱼微卫星标记的筛选及其遗传多
样性与保护策略的研究
指导教师: 黎中宝教授
作者姓名: 张志红
申请学位级别: 硕士
专业名称: 水生生物学
论文提交日期: 2011 年 05 月 15 日
论文答辩日期: 2011 年 06 月 14 日
学位授予单位: 集美大学
学位授予日期: 2011 年 06 月
答辩委员会主席: 聂品研究员
论文评阅人: 聂品研究员
吴仲庆教授
硕士学位论文
文昌鱼微卫星标记的筛选及其遗传多样性与保
护策略的研究
Development of the microsatellite and
ic diversity and conservation strategies of
Branchiostoma belcheri Gray
学科门类: 理学
作者姓名: 张志红
指导教师: 黎中宝教授
专业名称: 水生生物学
学位授予单位: 集美大学
论文答辩日期: 2011 年 06 月 14 日
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大
学
硕
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学
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文
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的
研
究
张
志
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文昌鱼微卫星标记的筛选及其遗传多样性
与保护策略的研究
摘要
文昌鱼(Amphioxus)是在进化地位上处于无脊椎动物与脊柱动物之间的中间过渡物
种,是新兴的模式动物之一。厦门刘五店曾是世界上著名的具有渔业捕捞价值的文昌鱼产
地,但是由于生境破坏、环境污染和捕捞过度的原因,文昌鱼的资源量急剧下降,已被列
为国家二级保护动物。为了给厦门文昌鱼(Branchiostoma belcheri Gray)的遗传保护提供
分子水平上的理论依据,本研究运用微卫星标记技术和 mtDNA 12S rRNA、COII、COIII
标记技术分析文昌鱼基因频率的分布、遗传多样性、遗传分化等群体遗传学方面的内容。
同时,根据以上分析确定文昌鱼的进化显著单元(ESU)和管理单元(MU),进一步完
善文昌鱼在保护遗传学方面的研究,以期为厦门文昌鱼保护策略的制定提供依据和建议。
本研究采用 FIASCO 法筛选出了 8 对文昌鱼微卫星多态性引物,并对文昌鱼 4 个群体
(大嶝岛水域群体、南线至十八线东端群体、南线至十八线西端群体、黄厝水域群体)的
遗传多样性和遗传分化进行了分析;运用 mtDNA 12S rRNA、COII、COIII 标记,分析了文
昌鱼 4 个群体的序列特征、群体遗传多样性和遗传变异,并进行了分子中性进化检验。
(1)采用 FIASCO 法,利用 bio-(GT)15、bio-(CT)15 的混合探针构建文昌鱼(CA)n、(GA)n
微卫星文库。挑取 100 个片段长度为 300-1200bp 的克隆振荡培养并测序,经过序列筛选,
设计了 41 对微卫星引物。以 30 个文昌鱼个体对多态性微卫星位点进行评价,共检测出 8
对多态性引物,其等位基因数为 3-10 个,多态信息含量(PIC)为 -,观察杂合
度为 -,期望杂合度为 -。位点多态性分析结果显示,除位点 Brb8
(PIC:)、 Brb90(PIC:)为中度多态外,其余 6 个位点均大于 ,具有高
度多态性,适合进行种群遗传学研究。
(2)利用自行筛选的 8 对微卫星引物和援引 3 对青岛文昌鱼引物,对 4 个文昌鱼群
体的遗传结构进行研究,分析了各群体内的遗传多样性和群体间的遗传分化。文昌鱼 4 个
群体