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胸腺嘧啶分子表面增强拉曼光谱的密度泛函理论和从头计算研究陈善俊,陈艳苄阄,罗炳池钕膊,唐永建镂拦引言砺奂扑惴椒,常规拉曼散射馄缀蚑階右约癆合已有实验值;而对于光谱,采用方法的计算结果更好。最后,通过墒踊砑胸腺嘧啶是脱氧核糖核酸的四个碱基之一,在基因表达附分子拉曼散射信号的一种现象馄卓梢蕴峁┯对胸腺嘧啶的光谱进行了计算。计算时分别采用了两键和—等还研究了胸腺嘧啶与铜电极相互作用的振动光谱,计算时采用的是原子与研究中,理论计算均只采用了一种计算方法。本工作将分子与金属原子结合有四种可能的结合方式,而原子与过,所以本工作采用了这种吸附方式。对计算所得的振动频第卷,第期光谱学与光谱分析摘要采用量子化学含电子相关效应的杂化密度泛函椒ê虷,哈特利一福克方法,在琀,琌疞水平上,对,胸腺嘧啶肿咏辛思负谓构优化,计算了分子的团簇吸附的,表面增强拉曼散射馄祝⒔街掷砺鄯椒ḿ扑愕结果和实验值进行比较。结果表明:对于馄祝捎肈方法的计算结果比方法的计算结果更符分子的振动频率进行了更为全面地归属。关键词胸腺嘧啶;表面增强拉曼散射;密度泛函理论;哈特利一福克方法;频率归属中图分类号:.文献标识码:痡..———和基因复制中起着很重要的作用。它虽然是所有碱基中最简单的一个,但由于其在生物化学方面的重要性,所以是理论研究中频繁关注的课题’。拉曼光谱是研究分子结构和分子振动光谱的重要工具之一。是一种发生于银、金、铜等少数金属的粗糙电极及其纳米粒子表面,可极大地增强吸关分子的结构变化或方向信息,而且近年来已达到单分子检测水平;虷椒ǹ梢杂美醇扑惴肿拥慕峁购驼穸光谱,目前已得到广泛应用。。利用这两种方法,将理论结果和实验值比较可以更清晰了解分子内部信息在已有的研究中,虰指出胸腺嘧啶分子与金属原子结合至少有四种可能的结合方式,金属原子可能与胸腺嘧啶分子的两个雍土礁原子中的任何一个形成化学键。”仍擞肈计算了胸腺嘧啶的光谱,并将理论计算的结果与胸腺嘧啶在银胶中的光谱进行了比较,推测出原子是通过与胸腺嘧啶中的形成一姆绞浇岷系摹等研究了胸腺嘧啶与金溶胶和银溶胶相互作用的光谱,并运用种结合方式,原子和原子均与和形成—相互作用的吸附方式。并通过理论结果与实验值的比较分析得出了胸腺嘧啶分子吸附在金属表面的结构信息。但在这些和两种理论计算方法相结合,并将计算结果与已有的实验值斜冉稀M盇和赋龅男叵汆奏胸腺嘧啶中的·形成一奈椒绞交姑挥腥搜芯率,结合可视化软件显示的振动模式,对该分子的拉曼振动光谱进行了更为全面地归属。理论计算采用量子化学程序包Ⅱ,。在优化结构的基础上采用同样的方法进行振动频率计算。分子的振动模式通过进行观测。计算时,程序包采用方法和作者简介:陈善俊,年生,四川大学物理科学与技术学院博士研究生泄こ涛锢硌芯吭杭す饩郾溲芯恐行模拇嘌拇ù笱г佑敕肿游锢硌芯克拇ǔ啥收稿日期:——。修订日期:——基金项目:国家自然科学基金项目资助ㄑ读O等:—.琋琾:.
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睭琀,琌№。图直鹗遣捎肈研、第期光谱学与光谱分析度泛函理论的椒ǎ械募扑憬峁际莖,珻通过比较,发现运用两种方法计算的理论值均与实验结别主要是由于在理论计算时,模拟的是单个分子测试的是分子的共同表现,存在着分子问作用力。晶体粉末中两个分子之问可能形