文档介绍：线粒体 COI、COII 和 CYTB 基因在鲍属物种鉴定中的适用性
分析
1,2
辛一
(1. 中国科学院海洋研究所, 山东青岛 266071; 2. 中国科学院研究生院, 北京 100049)
摘要: 为寻找最适于进行鲍属物种鉴定的线粒体基因, 测定了中国及日本沿海 5 个皱纹盘鲍(Haliotis
discus hannai)群体共 16 个个体的线粒体基因 COI、COII 以及 CYTB 的完整序列, 并结合杂色鲍(H.
diversicolor)、疣鲍(H. tuberculata)和黑唇鲍(H. rubra)的线粒体基因组信息, 比较分析了 3 种基因的 G+C
含量、种间/种内遗传距离和序列多态性等特征。研究结果表明, 上述 3 种基因的序列构成和遗传多样
性都具有一定相似性, 且三者都可用于区分上述鲍属物种。鉴于目前 COI 具有完善的通用引物, 并且
具有较多的公布序列, 本研究建议采用 COI 序列作为目前鲍属物种鉴定的 DNA 条形码。
关键词: 鲍属(Haliotis); DNA 条形码; 线粒体基因; 物种鉴定
中图分类号: ; Q3491; 文献标识码: A 文章编号: 1000-3096(2011)11-0058-05
鲍(Haliotis)是一种藻食性海洋动物, 有 7 个种基于线粒体基因的分子标记在鲍属物种鉴定中的进
分布于中国沿海[1], 其中皱纹盘鲍(H. discus hannai) 一步应用提供理论依据。
和杂色鲍(H. diversicolor)等都是重要的养殖贝类[2]。
1 材料和方法
中国北方普遍养殖的皱纹盘鲍和原产于日本的盘鲍
(H. discus discus)在形态和生态上非常相似, 对它们 样本采集
[3-4]
的分类地位尚存在不同意见; 此外, 原产于中国选取中国大连、青岛、威海、汕头以及日本宫
台湾的九孔鲍(H. diversicolor supertexta)与南方沿海城 5 个皱纹盘鲍群体共 16 个个体, 每个群体至少取
的杂色鲍(H. diversicolor diversicolor)在外部形态和 2 个个体, 包含在至少 2 个取样点中。所有样本在
生长特性方面虽存在一定差别, 但对于是否将二者-80℃下冷冻保存, 或固定保存于 70%~80%酒精
[1, 5]
划分为亚种仍有争议。中。所有样本的采集地、样本编号、GenBank 序列
线粒体 DNA 作为一种常用的分子标记, 已在软号等详细信息见表 1, 其中 3 个杂色鲍的线粒体基因
体动物的系统发生、物种鉴定和种群结构等研究中组数据已在之前的相关工作中获得(数据未发表)。
得到广泛应用[6-7]。线粒体 COI 基因中的部分区域由
DNA 片段的扩增与测序
于其变异速率适中及具有完善的通用引物, 常被用
[12]
[8] 采用 Sambrook 等介绍的苯酚氯仿法抽提样
作物种鉴定的 DNA 条形码。尽管基于线粒体基因
[9-11] 本 DNA。根据 GenBank 中皱纹盘鲍线粒体 DNA 序
的分子标记在鲍属物种鉴定中的应用已有报道,
列(EU59578