蛋白质核酸复合物氢键与范德华力作用位点分析.pdf

文档介绍：蛋白质核酸复合物氢键与范德华力作用位点分析
吴建盛胡栋晏善成马昕谢建明孙啸
南京邮电大学地理与生物信息学院,南京
东南大学生物电子学国家重点实验室,南京
摘要:为了深入了解蛋白质核酸相互作用模式,对复合物结构中氢键范德华力作用力位点上
的氨基酸和核苷酸的偏好性(即相对使用频率)进行了统计分析结果表明:氢键范德华力作用
位点上对氨基酸的偏好性差异均极其显著,与蛋白质核酸特异作用密切相关的残基侧链与核苷
酸碱基间相互作用力位点对氨基酸类型的选择特异性更高;单链分子与蛋白质发生相互
作用时对氨基酸残基的偏好性和双链分子差异不显著;氨基酸的极性大小及方向在决定
其是否与核酸分子形成范德华力作用具有重要贡献,氨基酸侧链形成的空间位阻会阻碍其与核
酸分子形成氢键作用;蛋白质复合物结构氢键范德华力作用位点上残基间空间协同作用
时对氨基酸类型的选择与蛋白质复合物结构间存在显著差异
蛋白质核酸复合物;氢键作用位点;范德华力作用位点;偏好性;氨基酸极性;协同作用




吴建盛(),男,博士,讲师;孙啸(联系人):男,博士,教授,博士生导师,
国家自然科学基金资助项目、南京邮电大学科研启动基金资助项目
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吴建盛,胡栋,伍洪涛,等蛋白质核酸复合物界面氨
基酸与核苷酸偏好性分析生物物理学报,,
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