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ntsys软件使用详细说明.doc

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ntsys软件使用详细说明.doc

上传人:zhongxinado 2020/7/30 文件大小:311 KB

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ntsys软件使用详细说明.doc

文档介绍

文档介绍::excel5/95格式数据1)首先得到0/1数据,输入excel中,格式如图所示:其中1表示数据格式为rectangulardatamatrix,12表示数据共12行(本例中表示12个个体),30表示数据共30列(本例中表示30个位点),0表示无缺失数据(若有缺失,则用1表示,缺失值可用-999或其它数字代替)。2)格式及数据输入正确后,点击另存为excel5/95格式,。3)采用NTedit数据编辑器打开所保存的文件agrid,在文件类型中选择excel格式,找到要分析的文件并打开,查看是否有错误,或需要修改的地方,没有问题后,。:txt格式数据1)另一种数据处理方法,首先在excel中得到数据,如下图(注意:第一行与第一种方法不同,1表示数据格式为rectangulardatamatrix;12B表示共12行(本例中表示12个个体,行标签位于数据主体的开始,B表示Beginningofeachrow),30L表示共30列(本例中表示30个位点,L:label表示列标签),0表示无缺失)。或者如下图格式(其中第一行为112L30L0,解释略;第二行为每行的行标签;第三行为每列的列标签;第四行起为数据主体。):2)格式及数据都处理好之后,点文件另存为,。3)得到txt格式文件后,即可直接用ntsys进行分析(只要格式正确,ntsys可以对txt文件进行分析,)。:直接采用NTedit进行数据的输入和保存1)对于数据量不大的数据,可以直接采用NTedit进行数据的输入,如图所示:2)数据输入好后,。(distancematrixorsimilaritymatrix)对于0/1数据和定性数据:打开ntsys软件,在similarity模块中选择simqual,inputfile中输入要分析的文件名称,,计算方法中矩阵系数coefficient选择dice,outputfile命名输出文件名称如aflp01-dice。pute,得到相似性矩阵。注:,所以要在Byrows?进行勾选(表选中)。如果个体是按列进行排列的,则不勾选。,如DICE,J,SM,PHI等。,J只能得到相似性矩阵,可以采用1-dice系数,或者1-J系数得到距离矩阵。(0/1),对于其它数据如DNA数据则采用simgend进行遗传距离计算,对于定量数据或间隔数据则采用simint计算距离矩阵。(clustering))在得到相似性矩阵或距离矩阵文件之后,采用clustering模块中的SAHN,inputfile选择相似性矩阵文件,如aflp01-,outputfile命名输出文件的名称,如aflp01-dice-,聚类方法中选择upgma,incaseofties选择find或者warn,pute得到结果,在程序左下角可以看到图标,点击