文档介绍：结构生物信息学基础知识和基本处理方法Outline生物学基本知识常用的生物数据及数据库处理生物数据的基本处理方法生物学两种主要信息载体核酸分子与蛋白质分子生物基础核酸分子核酸的基本单元式核苷酸。核苷酸有一个磷酸基团、一个糖基团和一个含有氮原子的碱基基团构成。根据糖基不同,核苷酸可分为:脱氧核糖核苷酸核糖核苷酸生物基础碱基糖基磷酸DNA(脱氧核糖核酸)RNA(核糖核酸)核苷+磷酸碱基+糖基核苷酸核酸聚合核酸分子–DNA和RNADNA的磷酸基团和糖基团都相同,碱基分为4种类型:腺嘌呤--A鸟嘌呤--G胞嘧啶--C胸腺嘧啶--T生物基础A只能与T配对C只能与G配对ACGT核酸分子–DNA和RNA多个脱氧核苷酸通过5’和3’形成磷酸二酯键连接而成的长DNA单链。通过碱基互补配对形成互补链,两条相互平行的DNA单链形成双螺旋结构。生物基础A--UC--GG--URNA通常是单链形式。RNA只有尿嘧啶(U)而没有胸腺嘧啶(T)DNA主要存在于细胞核内,RAN在细胞核外也存在。配对原则:蛋白质分子–生命活动的执行者蛋白质是由氨基酸通过肽键相链接形成的聚合物。氨基酸-蛋白质的基本组成单位,存在自然界中的氨基酸有300余种,但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种。生物基础氨基酸有一个位于中心的碳原子(Cα)以及用共价键相连的四个基团组成。氨基酸的通式RCα氨基羧基侧链甘氨酸HCH3丙氨酸氨基酸之间的差异主要体现在侧链部分蛋白质分子–生命活动的执行者20种标准氨基酸生物基础氨基酸名称英文缩写简写氨基酸名称英文缩写简写甘氨酸GlyG丝氨酸SerS丙氨酸AlaA苏氨酸ThrT缬氨酸ValV天冬酰胺AsnN异亮氨酸IleI谷酰胺GlnQ亮氨酸LeuL酪氨酸TyrY苯丙氨酸PheF组氨酸HisH脯氨酸ProP天冬氨酸AspD甲硫氨酸MetM谷氨酸GluE色氨酸TrpW赖氨酸LysK半胱氨酸CysC精氨酸ArgR蛋白质分子–生命活动的执行者生物基础氨基酸之间的差异主要体现在侧链部分氨基酸的侧链决定了不同氨基酸的物理化学性质RCα氨基羧基侧链蛋白质分子–生命活动的执行者氨基酸的分类生物基础碱性氨基酸酸性氨基酸极性中性氨基酸非极性疏水氨基酸