1 / 19
文档名称:

计算生物学.doc

格式:doc   大小:3,681KB   页数:19页
下载后只包含 1 个 DOC 格式的文档,没有任何的图纸或源代码,查看文件列表

如果您已付费下载过本站文档,您可以点这里二次下载

分享

预览

计算生物学.doc

上传人:rdwiirh 2020/9/14 文件大小:3.59 MB

下载得到文件列表

计算生物学.doc

文档介绍

文档介绍:?tRNA,mRNA,protein,?tRNA-mRNA;mRNA-?tRNA的移动过程;?水分子;离子;药物小分子等第一讲:学科间的关联•首先锁定研究对象:分子+环境,或者更大的体系–分子:单个或几个分子,千万个分子–环境:多个分子,连续介质•计算途径:原理+算法–原理:物理学,化学,生物学–算法:数学、统计学不同体系,不同方法Multipleproteins蛋白质内部,buriedmolecule,loopflipping蛋白质之间:bindingsitesRotationH-bondingElectrostaticinteractionVanderWaalsinteraction精确的计算方法,快速的近似方法质内部,buriedmolecule,loopflipping蛋白质之间:bindingsitesRotationH-bondingElectrostaticinteractionVanderWaalsinteraction精确的计算方法,快速的近似方法数学、统计学•数字拟合,分类与回归,贝叶斯推断,蒙特卡罗方法,马尔可夫链•微分方程解析解与数值解,矩阵与数值计算•集合,拓扑学,图论,群伦,排列组合计算机科学•Linux操作系统:–puting,–puting(并行计算),MPI–Linuxscripts,sed,awk–Perl,Python,Fortran,C++,Java•MySQL,PHP,Apache•Windows视窗:MATLAB,R,Java,物理学经典力学量子力学相对论处理热力学统计力学电动力学凝聚态理论 puters•微机类:Pymol,Rasmol,R,Matlab,Mathmatica•工作站:Gaussian,CHARMM,DOCKCPU计算,GPU图形•集群计算机Cluster:MPI硬盘阵列RAID(redundantarrayofindependentdisks)高性能计算High-puting(HPC)1012=teraFLOPS(floating-pointoperationspersecond)•puting方法:1、量子化学:Gaussian从头算、半经验方法密度泛函分子反应动力学、带结构2、分子动力学:CHARMM蛋白质模拟量子/经典混杂方法3、分子对接:DOCK药物设计应用::实验数据,:分子和材料的结构与性能辅助化学合成药物设计、催化剂设计结构-性质关系QSPR结构-活性关系QSAR生物信息学Bioinformatics•数据挖掘datamining•机器学习machinelearning/artificialintelligence–算法:决策树Decisiontree,随机森林Randomforests,关联式规则Associationrule,works,icprogramming,诱导逻辑编程Inductivelogicprogramming,支持向量机Supportvectormachines,聚类Clustering,works,系综学习Ensemblelearning,…–应用:模式识别patternrecognition•分类Classification,回归Regression,…•可视化visualization方法Methods•信息Informationdatabases,datamining,webtechnologies,onlinequery,sequencing,alignment,discovery,judge,•理解Understandingimageprocessing,visualization,statistics,datafitting,modeling,•预测Predictioninteraction,energyterms,scoringfunction,simulation,structure,superposition第二讲:经典力学一、与研究对象如何关联?二、现有的方法合理吗?三、你自己关心的问题如何描述?torsionDihedralδ=0,π;cos(δ)cos(mφ)=cos(mφ+δ)第三讲:分子间相互作用•有哪些分子间相互作用?•能量表达项重叠吗?•加和与权重?静电

最近更新

二零二五年度绿色环保小区住宅租赁服务协议 8页

二轮承包延长三十年对农户土地流转意愿的影响.. 6页

乡村振兴背景下海城区食用菌产业现状与前景探.. 4页

中小微企业人才招聘与激励管理研究 4页

不确定系统的分数阶鲁棒控制研究 4页

世界之美大学美育2500字 5页

一种程控变频电源GPIB接口的设计与实现 6页

《美育》课程标准 4页

二零二五年度智能园区监控运维服务合同 9页

二零二五年度旅游度假区车位租赁管理协议 8页

kpi绩效考核三大指标表 6页

ERP在国家电网公司中的典型设计研究 6页

2025年音乐教师个人年度工作计划(7) 6页

2025年全新人力资源管理师二级考试重点总结 5页

2025年 中国美术学院135107美术《553数字媒体.. 4页

二零二五年度内墙乳胶漆施工质量检测与认证服.. 8页

二零二五年度企业员工集体宿舍使用合同 9页

二零二五年度专业护工针对心血管疾病病人护理.. 10页

个性化快递服务协议范本 8页

2025年度高科技研发项目合同转让方协议 10页

第七单元第三节城市空间结构 38页

2025年度车辆质押贷款信用保证合同 9页

2025年度蔬菜大棚温室租赁与农业生态环境保护.. 9页

2025年度股东股权变更及企业品牌战略合作协议.. 8页

2025年度绿色建筑设计与施工劳务合同书 9页

2025年度离婚两清协议,共同债务分担与子女抚.. 9页

2025年度电力工程现场临时电力维修合同 10页

2025年度特色商业街区商铺租赁合同意向书 8页

2025年度海上风电场施工建设合同 10页

2025年度校园安防监控升级服务合同 9页