1 / 19
文档名称:

计算生物学.doc

格式:doc   大小:3,681KB   页数:19页
下载后只包含 1 个 DOC 格式的文档,没有任何的图纸或源代码,查看文件列表

如果您已付费下载过本站文档,您可以点这里二次下载

分享

预览

计算生物学.doc

上传人:rdwiirh 2020/9/14 文件大小:3.59 MB

下载得到文件列表

计算生物学.doc

文档介绍

文档介绍:?tRNA,mRNA,protein,?tRNA-mRNA;mRNA-?tRNA的移动过程;?水分子;离子;药物小分子等第一讲:学科间的关联•首先锁定研究对象:分子+环境,或者更大的体系–分子:单个或几个分子,千万个分子–环境:多个分子,连续介质•计算途径:原理+算法–原理:物理学,化学,生物学–算法:数学、统计学不同体系,不同方法Multipleproteins蛋白质内部,buriedmolecule,loopflipping蛋白质之间:bindingsitesRotationH-bondingElectrostaticinteractionVanderWaalsinteraction精确的计算方法,快速的近似方法质内部,buriedmolecule,loopflipping蛋白质之间:bindingsitesRotationH-bondingElectrostaticinteractionVanderWaalsinteraction精确的计算方法,快速的近似方法数学、统计学•数字拟合,分类与回归,贝叶斯推断,蒙特卡罗方法,马尔可夫链•微分方程解析解与数值解,矩阵与数值计算•集合,拓扑学,图论,群伦,排列组合计算机科学•Linux操作系统:–puting,–puting(并行计算),MPI–Linuxscripts,sed,awk–Perl,Python,Fortran,C++,Java•MySQL,PHP,Apache•Windows视窗:MATLAB,R,Java,物理学经典力学量子力学相对论处理热力学统计力学电动力学凝聚态理论 puters•微机类:Pymol,Rasmol,R,Matlab,Mathmatica•工作站:Gaussian,CHARMM,DOCKCPU计算,GPU图形•集群计算机Cluster:MPI硬盘阵列RAID(redundantarrayofindependentdisks)高性能计算High-puting(HPC)1012=teraFLOPS(floating-pointoperationspersecond)•puting方法:1、量子化学:Gaussian从头算、半经验方法密度泛函分子反应动力学、带结构2、分子动力学:CHARMM蛋白质模拟量子/经典混杂方法3、分子对接:DOCK药物设计应用::实验数据,:分子和材料的结构与性能辅助化学合成药物设计、催化剂设计结构-性质关系QSPR结构-活性关系QSAR生物信息学Bioinformatics•数据挖掘datamining•机器学习machinelearning/artificialintelligence–算法:决策树Decisiontree,随机森林Randomforests,关联式规则Associationrule,works,icprogramming,诱导逻辑编程Inductivelogicprogramming,支持向量机Supportvectormachines,聚类Clustering,works,系综学习Ensemblelearning,…–应用:模式识别patternrecognition•分类Classification,回归Regression,…•可视化visualization方法Methods•信息Informationdatabases,datamining,webtechnologies,onlinequery,sequencing,alignment,discovery,judge,•理解Understandingimageprocessing,visualization,statistics,datafitting,modeling,•预测Predictioninteraction,energyterms,scoringfunction,simulation,structure,superposition第二讲:经典力学一、与研究对象如何关联?二、现有的方法合理吗?三、你自己关心的问题如何描述?torsionDihedralδ=0,π;cos(δ)cos(mφ)=cos(mφ+δ)第三讲:分子间相互作用•有哪些分子间相互作用?•能量表达项重叠吗?•加和与权重?静电

最近更新

关于我省生猪问题的分析预测和对策建议 2页

2025年肌萎缩侧索硬化症全面解析 22页

2025年生物处理设备项目合作计划书 63页

2025年硼酸盐项目建议书 51页

2025年糖尿病运动疗法效果探究 35页

关于工业机器人回转驱动部分动态特性的研究 2页

2025年糖尿病患者运动康复指南 32页

关于多维数组排序优化算法的探讨 2页

关于国际贸易中保障措施的若干问题探讨 2页

关于发展高效率异步电动机系列的初步探讨(二).. 2页

关于印度的发展道路问题的讨论 2页

关于价格改革中几个理论与政策问题的思考 2页

关于中等城市“智慧城市”建设的相关问题的探.. 2页

2025年昏迷急救处理与临床诊断策略 46页

《银行客户经理认知》 9页

2025年护士心理健康危机的应对策略 60页

六二年提高产品质量、加强技术管理的收获和体.. 2页

八十年代对宇航材料和工艺的要求 2页

人教版小学三年级英语下册第四单元第一课时 12页

全国首届有色金属材料应用技术交流会在湘召开.. 2页

全国第二届加筋土技术经验交流会简介 2页

2025年大学生常见心理困扰解析 33页

2025年均衡膳食乐享健康 41页

2025年呼吸衰竭患者护理要点探讨 49页

2025年古籍揭秘无花果神奇功效助力抗癌促消化.. 7页

光敏性单克隆抗体的制备及其杀伤细胞的探索 2页

小学科学教科版五年级下册第二单元《船的研究.. 4页

比例的意义公开课省公开课金奖全国赛课一等奖.. 19页

建筑桩基技术规范 4页

爱华仕箱包营销推广方案 33页